delecja genu
Delecja genu to rodzaj mutacji strukturalnej, polegającej na utracie fragmentu materiału genetycznego. Może obejmować niewielkie odcinki DNA (mikro i nanodelecje), całe geny lub większe fragmenty chromosomów. Delecje powstają najczęściej wskutek błędów podczas replikacji DNA lub w wyniku nieprawidłowej rekombinacji podczas podziału komórkowego.
Konsekwencje delecji genu zależą od jego funkcji oraz wielkości utraconego fragmentu. Całkowita utrata genu kodującego ważne białko może prowadzić do poważnych zaburzeń rozwojowych lub chorób genetycznych. Przykładami schorzeń związanych z delecjami są zespół Williamsa (delecja fragmentu chromosomu 7), zespół DiGeorge’a (delecja 22q11.2) czy dystrofia mięśniowa Duchenne’a (delecje w genie DMD).
W diagnostyce molekularnej delecji genów wykorzystuje się metody takie jak porównawcza hybrydyzacja genomowa (CGH), MLPA (multiplex ligation-dependent probe amplification), FISH (fluorescencyjna hybrydyzacja in situ) oraz sekwencjonowanie nowej generacji (NGS). Identyfikacja delecji ma istotne znaczenie w diagnostyce prenatalnej, poradnictwie genetycznym oraz w medycynie personalizowanej.
Powiązane wpisy
- Leksykon chorób i schorzeń
Sarcoma nabłonkowate – Etiologia i przyczyny
Sarcoma nabłonkowate jest rzadkim, złośliwym nowotworem tkanek miękkich, którego główną etiologiczną determinantą jest inaktywacja genu supresorowego SMARCB1/INI1 (chromosom 22q11.2), obserwowana w 80-90% przypadków. Utrata funkcji tego genu prowadzi do dysregulacji kompleksu SWI/SNF, co skutkuje niekontrolowanym wzrostem komórek i transformacją nowotworową. Kluczowe mechanizmy molekularne obejmują nadaktywację PRC2, metylację histonu H3K27, zwiększoną ekspresję VEGF, utratę E-kadheryny oraz aktywację szlaku PI3K/AKT/mTOR. W etiologii uwzględnia się także delecje genów i rearanżacje, w tym translokacje w locus 22q11. Dodatkowo, metylotransferazy histonowe odgrywają rolę w represji genów różnicowania komórek, co sprzyja progresji nowotworu.
angiogeneza, czynnik wzrostu śródbłonka naczyniowego, delecja genu, dysfagia, E-kadheryna, gen SMARCB1, gen supresorowy nowotworu, inaktywacja SMARCB1, kompleks PRC2, metylotransferaza histonowa, nerwiakowłókniakowatość, nowotwór tkanek miękkich, obrzęk limfatyczny, polichlorofenol, polipowatość gruczolakowata, radioterapia, sarcoma nabłonkowate, siatkówczak, stwardnienie guzowate, szlak sygnałowy, szlak sygnałowy PI3K/AKT/mTOR, transformacja nowotworowa, transkrypcja DNA, uraz, zespół Gardnera, zespół Gorlina, zespół Li-Fraumeni, zespół nowotworowy, zespół Wernera - Leksykon chorób i schorzeń
Wrodzony przerost nadnerczy – Etiologia i przyczyny
Wrodzony przerost nadnerczy (CAH) to grupa autosomalnie recesywnie dziedziczonych zaburzeń genetycznych, wynikających głównie z mutacji w genie CYP21A2, kodującym enzym 21-hydroksylazę, odpowiedzialną za syntezę kortyzolu i aldosteronu. Niedobór tego enzymu, stanowiący 90-95% przypadków, prowadzi do zmniejszonej produkcji kortyzolu i często aldosteronu, z jednoczesnym wzrostem androgenów nadnerczowych. W efekcie dochodzi do hiperplazji nadnerczy, nadmiernej produkcji androgenów oraz zaburzeń gospodarki wodno-elektrolitowej, szczególnie w klasycznej postaci CAH z utratą soli. Mutacje w genie CYP21A2 różnią się pod względem wpływu na aktywność enzymatyczną, co determinuje fenotyp kliniczny – od ciężkiej formy z całkowitym brakiem aktywności enzymu, przez prostą formę wirylizującą (1-2% aktywności), po formę nieklasyczną z zachowaną aktywnością na poziomie 20-60%. Rzadziej występują mutacje w innych genach enzymów steroidogenezy, takich jak CYP11B1, HSD3B2, CYP17A1, białko StAR czy oksydoreduktaza cytochromu P450, które odpowiadają za około 5% przypadków CAH i manifestują się odmiennym obrazem klinicznym, w tym nadciśnieniem tętniczym i zaburzeniami rozwoju płciowego.
androgeny nadnerczowe, CAH z utratą soli, delecja genu, diagnostyka prenatalna, dziedziczenie autosomalne recesywne, gen CYP21A2, hiperkaliemia, hiperplazja, hiponatremia, hormon adrenokortykotropowy, klasyczna postać CAH, konwersja genowa, mutacja punktowa, niedobór 11β-hydroksylazy, niedobór 21-hydroksylazy, niedobór oksydoreduktazy cytochromu P450, nieklasyczna postać CAH, pseudogen CYP21A1P, steroidogeneza, synteza kortyzolu, terapia genowa, wrodzony przerost nadnerczy - Leksykon chorób i schorzeń
Zaburzenie rozwoju koordynacji ruchowej (dyspraksja) – Patofizjologia i mechanizm
Zaburzenie rozwoju koordynacji ruchowej (dyspraksja) to neurorozwojowe schorzenie dotykające 5-15% dzieci w wieku szkolnym, charakteryzujące się nieprawidłową koordynacją ruchową, która nie wynika z braku praktyki czy instrukcji. Etiologia jest heterogeniczna i obejmuje nieprawidłowości w rozwoju neurologicznym, zaburzenia w korze mózgowej, móżdżku oraz deficyty w transmisji informacji między mózgiem a ciałem. Badania fMRI wykazują nieprawidłowe wzorce aktywacji i połączeń istoty białej w mózgu, a genetyczne podłoże potwierdzają mutacje, m.in. delecja genu 16p11.2. Czynniki ryzyka to wcześniactwo (<37 tygodnia), niska masa urodzeniowa, predyspozycje genetyczne oraz komplikacje okołoporodowe. Dyspraksja współwystępuje często z ADHD (ok. 50%), ASD, dysleksją i zaburzeniami mowy, co komplikuje diagnostykę i terapię.
ADHD, delecja genu, dysgrafia, dysleksja, dyspraksja, funkcjonalny rezonans magnetyczny, kamienie milowe rozwoju motorycznego, kora ciemieniowa, kora czołowa, kora przedczołowa, niska masa urodzeniowa, ośrodkowy układ nerwowy, plastyczność mózgu, podłoże genetyczne, prążkowie, przeciążenie sensoryczne, uczenie się motoryczne, wcześniactwo, zaburzenia poznawcze, zaburzenia ze spektrum autyzmu, zaburzenie integracji sensorycznej, zaburzenie neurorozwojowe - Leksykon chorób i schorzeń
Talasemia – Patofizjologia i mechanizm
Talasemia to grupa genetycznych zaburzeń krwi charakteryzujących się mutacjami lub delecjami w genach globinowych (HBA1, HBA2 dla alfa-talasemii na chromosomie 16 oraz HBB dla beta-talasemii na chromosomie 11), prowadzącymi do nieefektywnej erytropoezy i zaburzenia równowagi produkcji łańcuchów alfa- i beta-globinowych. W beta-talasemii mutacje punktowe powodują zmniejszoną (β+) lub całkowitą (β0) syntezę łańcuchów beta, co skutkuje nadmiarem łańcuchów alfa, które tworzą niestabilne agregaty uszkadzające erytroblasty i erytrocyty, wywołując stres oksydacyjny i hemolizę. W alfa-talasemii delecje genów prowadzą do nadmiaru łańcuchów beta, które tworzą nieprawidłowe tetramery HbH, również powodując hemolizę. Nieefektywna erytropoeza jest nasilona przez aktywację szlaku JAK2 oraz sekwestrację białka HSP70, co hamuje czynnik transkrypcyjny GATA1 i prowadzi do apoptozy erytroblastów. Kompensacyjnie obserwuje się wzrost ekspresji hemoglobiny płodowej (HbF, α2γ2), której produkcję można farmakologicznie zwiększać hydroksymocznikiem. Przeładowanie żelazem, wynikające z zahamowania hepcydyny i zwiększonego wchłaniania żelaza, prowadzi do odkładania żelaza w narządach (serce, wątroba, gruczoły endokrynne) i poważnych powikłań, będących główną przyczyną śmierci u pacjentów z talasemią.
alfa-talasemia, apoptoza, beta-talasemia major, beta-talasemia minor, beta+-talasemia, choroba sierpowatokrwinkowa, delecja genu, dziedziczenie autosomalne recesywne, gen HBB, hemoglobina H, hemoglobina płodowa, hemoglobinopatia, hemoliza wewnątrzszpikowa, hepcydyna, hipocholesterolemia, homeostaza żelaza, łańcuch globinowy, luspatercept, mutacja punktowa, przeładowanie żelazem, przeszczep szpiku kostnego, reaktywne formy tlenu, stres oksydacyjny, synteza hemoglobiny, terapia genowa, zaburzenie równowagi - Leksykon chorób i schorzeń
Ichtyoza – Diagnostyka i diagnoza
Ichtyoza to grupa rzadkich, genetycznych zaburzeń rogowacenia skóry, charakteryzujących się nadmiernym nagromadzeniem zrogowaciałych komórek naskórka, co skutkuje suchą, łuszczącą się skórą o wyglądzie rybiej łuski. Diagnostyka ichtyozy wymaga podejścia multidyscyplinarnego, obejmującego ocenę kliniczną, badania histopatologiczne oraz genetyczne. Typowe formy to ichtyoza pospolita (mutacje w genie FLG, objawy pojawiają się między 3 a 12 miesiącem życia, histologicznie hiperkeratoza i zmniejszona warstwa ziarnista), ichtyoza związana z chromosomem X (deleje lub mutacje w genie STS, objawy od urodzenia, nieregularne zmętnienia rogówki, pogrubiona warstwa rogowa bez parakeratozy) oraz ichtyoza lamelarna (mutacje w genach TGM1, ALOX12B, ALOXE3, NIPAL4, CYP4F22, ABCA12, masywna ortohiperkeratoza i parakeratoza). Diagnostyka molekularna, w tym sekwencjonowanie nowej generacji (NGS), umożliwia identyfikację mutacji w ponad 30 genach, co pozwala na precyzyjną klasyfikację i poradnictwo genetyczne.
akantoza, badanie histopatologiczne, badanie kliniczne, badanie mikroskopowe, biopsja kosmówki, biopsja skóry, chłoniak T-komórkowy, choroba Hodgkina, czerwienica prawdziwa, delecja genu, diagnostyka molekularna, diagnostyka prenatalna, ektropion, filagryna, hiperkeratoza, ichtyoza, ichtyoza epidermolityczna, ichtyoza Harlekin, ichtyoza lamelarna, ichtyoza nabyta, ichtyoza pospolita, mutacja genowa, parakeratoza, pęcherzowe oddzielanie naskórka, płyn owodniowy, poradnictwo genetyczne, przeznaskórkowa utrata wody, sekwencjonowanie nowej generacji, sekwencjonowanie Sangera, sulfataza steroidowa, szpiczak mnogi, terapia genowa, transglutaminaza 1, warstwa ziarnista, zespół mielodysplastyczny - Leksykon chorób i schorzeń
Meningioma – Etiologia i przyczyny
Meningioma to nowotwór wywodzący się z opon mózgowo-rdzeniowych, którego etiologia jest wieloczynnikowa, obejmująca czynniki genetyczne, hormonalne i środowiskowe. Genetycznie, około 40-80% meningioma wykazuje aberracje chromosomu 22, zwłaszcza delecję genu NF2 (22q12), co jest dominującą cechą sporadycznych przypadków. Dodatkowo, mutacje w genach TRAF7, KLF4, AKT1 i SMO są często obecne w łagodnych meningioma podstawy czaszki. Predyspozycje genetyczne obejmują m.in. neurofibromatozę typu 2 (NF2), zespół von Hippel-Lindau, MEN1, Li-Fraumeni, Cowdena i Gorlina. Ekspozycja na promieniowanie jonizujące, zwłaszcza radioterapia głowy w dzieciństwie, zwiększa ryzyko rozwoju meningioma 6-10-krotnie. Epidemiologicznie, guzy te występują dwukrotnie częściej u kobiet, co wiąże się z obecnością receptorów hormonalnych (progesteronowych u 88%, estrogenowych i androgenowych po około 40%) oraz obserwowanym wzrostem tempa wzrostu guza w ciąży i cyklu miesiączkowym.
aberracja chromosomowa, choroba von Hippel-Lindau, delecja chromosomowa, delecja genu, doustna antykoncepcja, gen NF2, guz atypowy, hormonalna terapia zastępcza, insulinopodobny czynnik wzrostu, meningioma, neurofibromatoza typu 2, nieprawidłowość chromosomalna, niestabilność genomowa, octan cyproteronu, octan medroksyprogesteronu, opona mózgowo-rdzeniowa, pajęczynówka, promieniowanie jonizujące, radioterapia głowy, receptor androgenowy, receptor estrogenowy, receptor progesteronowy, tkanka tłuszczowa, utrata heterozygotyczności, wskaźnik masy ciała, zespół Cowdena, zespół Gorlina, zespół Li-Fraumeni, zespół mnogiej gruczolakowatości