metoda PCR

Metoda PCR (Polymerase Chain Reaction, reakcja łańcuchowa polimerazy) to technika molekularna służąca do powielania określonych fragmentów DNA. Opracowana w 1983 roku przez Kary’ego Mullisa, zrewolucjonizowała diagnostykę molekularną, umożliwiając amplifikację nawet niewielkich ilości materiału genetycznego do poziomu umożliwiającego analizę.

Podstawą metody PCR jest cykliczne powtarzanie trzech etapów: denaturacji DNA (rozdzielenie podwójnej helisy), przyłączania starterów (annealing) oraz wydłużania nici DNA przez polimerazę (elongacja). Proces ten prowadzi do wykładniczego namnażania specyficznego fragmentu DNA, ograniczonego przez parę starterów.

W diagnostyce medycznej PCR stosuje się do wykrywania patogenów (wirusów, bakterii), identyfikacji mutacji genetycznych, badań przesiewowych, testów ojcostwa oraz w medycynie sądowej. Modyfikacje podstawowej metody PCR, takie jak RT-PCR (z odwrotną transkrypcją), qPCR (PCR w czasie rzeczywistym) czy multipleks PCR, pozwalają na szerszy zakres zastosowań, w tym ilościową analizę ekspresji genów.

Powiązane wpisy

Leksykon substancji czynnych
Gancyklowir – Wskazania do stosowania

Gancyklowir, dostępny w postaci dożylnej (Cymevene, Ganciclovir Accord 500 mg) oraz żelu do oczu (Virgan 1,5 mg/g), jest lekiem przeciwwirusowym stosowanym głównie w leczeniu i profilaktyce zakażeń cytomegalowirusem (CMV) oraz w terapii zakażeń herpeswirusowych. U dorosłych i młodzieży powyżej 12 lat gancyklowir dożylny wskazany jest zarówno w leczeniu aktywnej choroby CMV (np. zapalenie siatkówki, płuc, jelita grubego) u pacjentów z obniżoną odpornością, jak i w profilaktyce wyprzedzającej u biorców przeszczepów narządów i komórek krwiotwórczych oraz pacjentów poddawanych intensywnej chemioterapii. U dzieci od urodzenia do 12 lat gancyklowir dożylny stosuje się wyłącznie w profilaktyce uniwersalnej CMV, niezależnie od statusu serologicznego, zwłaszcza u pacjentów z immunosupresją. Żel do oczu Virgan 1,5 mg/g jest z kolei wskazany w leczeniu powierzchownego ostrego zapalenia rogówki wywołanego przez wirusa Herpes simplex (HSV), obejmującego postaci punktowe, dendrytyczne i geograficzne owrzodzenia rogówki.
AIDS, chemioterapia nowotworowa, choroba cytomegalowirusowa, cytomegalowirus, herpes simplex, immunosupresja, komórki krwiotwórcze, leczenie wyprzedzające, metoda PCR, opryszczka pospolita, pacjent immunoniekompetentny, profilaktyka uniwersalna, przeszczep allogeniczny, przeszczep narządu miąższowego, punktowe zapalenie rogówki, replikacja wirusa, terapia immunosupresyjna, wirus HSV, zakażenie herpeswirusowe, zapalenie jelita grubego, zapalenie płuc, zapalenie rogówki, zapalenie siatkówki
Leksykon chorób i schorzeń
Biegunka krwotoczna – Diagnostyka i diagnoza

Biegunka krwotoczna (dysenteria) to zespół objawów żołądkowo-jelitowych charakteryzujący się obecnością krwi i/lub śluzu w luźnych, wodnistych stolcach, często z towarzyszącymi bólami brzucha, gorączką, nudnościami, wymiotami i parciem na stolec. Diagnostyka opiera się na szczegółowym wywiadzie, badaniu przedmiotowym oraz badaniach laboratoryjnych, w tym posiewie kału, badaniu mikroskopowym, testach immunoenzymatycznych (ELISA) i metodach molekularnych (PCR). Szczególną uwagę zwraca się na identyfikację patogenów takich jak Shigella spp., Entamoeba histolytica, Campylobacter, Salmonella, Yersinia oraz Clostridioides difficile. W przypadku shigellozy czułość posiewu wynosi około 6,6% w porównaniu do PCR, co podkreśla przewagę diagnostyki molekularnej. Badania krwi obejmują morfologię (leukocytoza, przewaga form pałeczkowatych neutrofilów), CRP oraz testy serologiczne, szczególnie przydatne w diagnostyce pełzakowicy. Wskazane są także badania endoskopowe i obrazowe w przypadku podejrzenia powikłań, np. ropnia wątroby.
antybiotykoterapia, azytromycyna, badanie mikroskopowe, białko C-reaktywne, biegunka krwotoczna, biegunka podróżnych, biopsja jelita, choroba Leśniowskiego-Crohna, ciprofloksacyna, Clostridioides difficile, czerwonka bakteryjna, dysfagia, Entamoeba histolytica, kolonoskopia, krew w kale, krwawa biegunka, leukocyty w kale, metoda PCR, metronidazol, morfologia krwi, multipleksowy test PCR, niedokrwienne zapalenie jelita grubego, posiew mikrobiologiczny, ropień wątroby, shigella, shigelloza, sigmoidoskopia, test ELISA, test serologiczny, wrzodziejące zapalenie jelita grubego, zapalenie jelit, zapalenie okrężnicy
Leksykon chorób i schorzeń
Wirusowe zapalenie wątroby typu c – Diagnostyka i diagnoza

Wirusowe zapalenie wątroby typu C (WZW C) stanowi istotny problem zdrowia publicznego, dotykając około 50 milionów osób globalnie, w tym 2,4 miliona w USA. Diagnostyka opiera się na dwuetapowym procesie: badaniu przesiewowym na obecność przeciwciał anty-HCV (testy EIA lub chemiluminescencyjne o czułości 95-99% i specyficzności >99%) oraz potwierdzeniu aktywnego zakażenia testem HCV RNA (PCR lub TMA), wykrywającym wirusa już po 1-2 tygodniach od infekcji. Testy refleksyjne, automatycznie wykonujące HCV RNA po dodatnim wyniku przeciwciał, usprawniają diagnostykę, choć stosuje je jedynie około 33% laboratoriów w USA. Interpretacja wyników uwzględnia obecność przeciwciał i RNA, co pozwala rozróżnić zakażenie aktywne, przebyte lub brak zakażenia. Ocena stopnia uszkodzenia wątroby obejmuje badania biochemiczne (ALT, AST, fosfataza alkaliczna, albumina, bilirubina, INR, eGFR) oraz nieinwazyjne metody oceny włóknienia (FibroScan, FIB-4, APRI) lub biopsję wątroby, klasyfikowaną według skali Metavir (F0-F4). Genotypowanie HCV, szczególnie istotne w USA, gdzie 74% zakażeń to genotyp 1, pomaga w doborze terapii, mimo że nowoczesne leki DAA są skuteczne wobec wszystkich genotypów.
aminotransferaza alaninowa, aminotransferaza asparaginianowa, biopsja wątroby, elastografia przejściowa, genotypowanie HCV, marskość wątroby, metoda PCR, okno serologiczne, ostre zakażenie HCV, przeciwciała anty-HCV, przewlekłe zakażenie HCV, rak wątrobowokomórkowy, RNA HCV, test immunoenzymatyczny, test przyłóżkowy, wiremia, wirus HCV, wirusowe zapalenie wątroby typu C, wskaźnik APRI, wskaźnik INR, zakażenie HBV, zakażenie HCV, zakażenie HIV
Leksykon chorób i schorzeń
Świnka – Charakterystyka, pielęgnacja i opieka

Świnka (parotitis epidemica) to wysoce zakaźna choroba wirusowa wywoływana przez paramyksowirus, charakteryzująca się obrzękiem i bolesnym powiększeniem ślinianek przyusznych. Okres inkubacji wynosi 16-18 dni (zakres 12-25 dni), a zakaźność trwa od kilku dni przed objawami do 5-9 dni po wystąpieniu obrzęku. Diagnostyka opiera się na obrazie klinicznym oraz badaniach serologicznych i PCR z wymazu z policzka. Powikłania, częstsze u dorosłych, obejmują aseptyczne zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych, zapalenie mózgu, orchitis (3-10% mężczyzn po dojrzewaniu), oophoritis (~1% kobiet), zapalenie trzustki, utratę słuchu oraz rzadziej zapalenie stawów, nerek i mięśnia sercowego. Leczenie jest objawowe, z zastosowaniem paracetamolu lub ibuprofenu, odpowiedniego nawodnienia i diety lekkostrawnej, unikania pokarmów kwaśnych oraz odpoczynku. Izolacja pacjenta powinna trwać 5 dni od początku obrzęku ślinianek, a personel medyczny bez odporności wymaga wyłączenia z pracy od 10-12 do 25 dni po ekspozycji.
badanie laboratoryjne, ciśnienie śródczaszkowe, etykieta oddechowa, izolacja pacjenta, leki przeciwbólowe, metoda PCR, niedobór odporności, odwodnienie, okres inkubacji, oophoritis, orchitis, paramyksowirus, parotitis epidemica, reakcja anafilaktyczna, standardowe środki ostrożności, szczepionka MMR, szczepionka MMRV, sztywność karku, test PCR, utrata słuchu, wirus świnki, wydzieliny z dróg oddechowych, zapalenie jąder, zapalenie jajników, zapalenie mięśnia sercowego, zapalenie mózgu, zapalenie nerek, zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych, zapalenie ślinianek, zapalenie ślinianek przyusznych, zapalenie stawów, zapalenie trzustki, zespół Reye’a
Leksykon chorób i schorzeń
Ospa prawdziwa – Epidemiologia

Ospa prawdziwa (variola vera), wywoływana przez wirusa z rodzaju Orthopoxvirus, była ostrą chorobą zakaźną charakteryzującą się gorączką, wysypką i śmiertelnością sięgającą do 30%. Choroba została całkowicie wyeliminowana w 1980 roku, co czyni ją pierwszą eradykowaną chorobą zakaźną u ludzi. Transmisja wirusa następowała głównie drogą kropelkową podczas bliskiego kontaktu, a pacjenci byli zakaźni od pojawienia się wysypki do odpadnięcia ostatniego strupa. Kluczowe cechy epidemiologiczne, takie jak brak bezobjawowego nosicielstwa i wyłączny rezerwuar ludzki, umożliwiły skuteczną eradykację. Strategia WHO opierała się na aktywnym nadzorze, izolacji chorych oraz szczepieniach pierścieniowych wokół przypadków, co pozwoliło na przerwanie łańcuchów transmisji. Ostatni naturalny przypadek odnotowano w 1977 roku, a od 1978 roku nie zgłoszono żadnych zachorowań.
bezobjawowe nosicielstwo, bezpieczeństwo biologiczne, bioterroryzm, choroba wysypkowa, definicja przypadku, DNA wirusa, droga kropelkowa, endemiczność, endemiczny, epidemia, eradykacja, infekcja, izolacja pacjenta, lek przeciwwirusowy, małpia ospa, metoda PCR, mpox, nadzór epidemiologiczny, odporność zbiorowiskowa, orthopokswirus, Orthopoxvirus, ospa prawdziwa, płyn ustrojowy, poxviridae, rezerwuar wirusa, śledzenie kontaktów, śmiertelność, system nadzoru, szczepienie, szczepienie pierścieniowe, transmisja wirusa, variola virus, wirus ospy prawdziwej, wybuch epidemii, wysypka
Leksykon chorób i schorzeń
Biegunka krwotoczna – Rokowania, prognozy i postęp choroby

Dyzenteria, zarówno amebowa, jak i bakteryjna, stanowi poważne wyzwanie kliniczne, zwłaszcza w krajach rozwijających się, gdzie rokowanie zależy od etiologii, szybkości wdrożenia leczenia, stanu immunologicznego pacjenta oraz dostępu do opieki medycznej. Przy prawidłowej terapii większość przypadków ustępuje w ciągu 10 dni, z pełnym powrotem do zdrowia w 2-4 tygodnie. Nieleczona choroba może prowadzić do poważnych powikłań, w tym śmierci, szczególnie u dzieci poniżej 5 roku życia, osób z niedożywieniem, odwodnieniem czy obniżoną odpornością. Modele kliniczne, takie jak CPM z AUC 0,84 (95% CI: 0,82-0,86) w badaniu GEMS, umożliwiają identyfikację pacjentów z wysokim ryzykiem zgonu, co pozwala na ukierunkowanie interwencji i efektywną alokację zasobów. W warunkach OIT biegunka występuje u 12,9% pacjentów i wiąże się z wydłużonym pobytem (średnio 14,8 vs 3,2 dni, p<0,001) oraz zwiększoną śmiertelnością (22,0% vs 8,7%, p<0,001).
amebiaza, badanie kohortowe, bakteriemia, biegunka krwotoczna, ciężkie niedożywienie, czułość testu, czynniki środowiskowe, dyzenteria, dyzenteria bakteryjna, etiologia infekcyjna, krwisty stolec, metoda PCR, model prognostyczny, nawodnienie, niedożywienie, oddział intensywnej terapii, odwodnienie, ostra biegunka, układ immunologiczny, wartość predykcyjna, współczynnik ryzyka, zachorowalność, zakażenie Shigella
Leksykon chorób i schorzeń
Gorączka q – Objawy

Gorączka Q, wywoływana przez Coxiella burnetii, może przebiegać w postaci ostrej lub przewlekłej. Ostra forma manifestuje się nagłą gorączką do 41°C, dreszczami, bólami głowy (często zaoczodołowymi), mięśni i stawów, suchym kaszlem oraz objawami ze strony przewodu pokarmowego. Powikłania obejmują atypowe zapalenie płuc (30-50% przypadków), zapalenie wątroby, zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych oraz rzadkie zapalenie mięśnia sercowego lub osierdzia. Okres inkubacji wynosi od 4 dni do 6 tygodni, a objawy ostrej gorączki Q utrzymują się zwykle 1-4 tygodnie. Śmiertelność w ostrej postaci jest niska (1-2%). Przewlekła gorączka Q, definiowana jako infekcja trwająca ponad 6 miesięcy, najczęściej objawia się zapaleniem wsierdzia, szczególnie u pacjentów z wadami zastawek, protezami naczyniowymi lub immunosupresją. Objawy przewlekłej postaci to niska gorączka, nocne poty, utrata masy ciała, duszność i obrzęki kończyn dolnych. Nieleczona przewlekła forma ma wysoką śmiertelność sięgającą 65%, która spada do około 10% przy odpowiedniej terapii antybiotykowej.
atypowe zapalenie płuc, badanie serologiczne, ból zaoczodołowy, Coxiella burnetii, doksycyklina, gorączka Q, hydroksychlorochina, metoda PCR, nocne poty, objawy depresyjne, okres inkubacji, ostra gorączka Q, ostra niewydolność oddechowa, przewlekła choroba nerek, przewlekła gorączka Q, światłowstręt, zaburzenia pamięci krótkotrwałej, zapalenie kości i szpiku, zapalenie łożyska, zapalenie mięśnia sercowego, zapalenie mózgu i rdzenia, zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych, zapalenie osierdzia, zapalenie stawów, zapalenie tętnic, zapalenie wsierdzia, zespół grypopodobny, zespół przewlekłego zmęczenia, zespół zmęczenia po gorączce Q
Leksykon chorób i schorzeń
Methicillin-resistant staphylococcus aureus – Epidemiologia

Staphylococcus aureus oporny na metycylinę (MRSA) stanowi istotne zagrożenie zdrowia publicznego, występując jako patogen oportunistyczny w środowiskach szpitalnych (HA-MRSA), społecznych (CA-MRSA) oraz związanych z hodowlą zwierząt (LA-MRSA). Częstość kolonizacji S. aureus w nosie wynosi około 33%, z czego około 2% populacji jest nosicielami MRSA, choć wartości te mogą być wyższe w określonych grupach. W 2023 roku odnotowano 714 131 przypadków zakażeń MRSA w siedmiu głównych krajach, a częstość występowania MRSA wśród izolatów klinicznych w Egipcie wynosiła 63% (95% CI: 55-70). Epidemiologia MRSA ulega zmianom, z rosnącą rolą CA-MRSA, zwłaszcza szczepu USA-300, oraz znaczącym wzrostem zakażeń w Kanadzie (wzrost o 35% do 1,13 zakażeń na 10 000 osobodni). Nadzór nad MRSA, zarówno aktywny (badania przesiewowe), jak i pasywny (monitorowanie zgłoszeń), jest kluczowy dla kontroli zakażeń, a metody diagnostyczne obejmują hodowlę, PCR oraz sekwencjonowanie całego genomu (WGS), które umożliwia precyzyjne śledzenie źródeł zakażeń i ewolucji szczepów. Czułość wykrywania MRSA jest wyższa w próbkach z gardła lub aspiratów tchawicy (82%) niż w nosie (47%).
aspirat tchawicy, badanie przesiewowe, bakteriemia MRSA, CA-MRSA, cewnik dożylny, cewnik moczowy, chlorheksydyna, czyrak, dekolonizacja, HA-MRSA, kolonizacja MRSA, kontrola zakażeń, LA-MRSA, leukocydyna Panton-Valentine, metoda PCR, MRSA, mupirocyna, nadzór aktywny, nosiciel bakterii, nosicielstwo, oddział intensywnej terapii, oporność na antybiotyki, oporność na środki przeciwdrobnoustrojowe, patogen oportunistyczny, procedura inwazyjna, ropień, sekwencjonowanie DNA, sekwencjonowanie genomu, system nadzoru, sztuczny staw, zakażenie HIV, zakażenie krwi, zakażenie MRSA, zakażenie skóry, zapalenie płuc MRSA, zarządzanie antybiotykami, zespół kontroli zakażeń
Leksykon chorób i schorzeń
Choroba hemolityczna płodu i noworodka (hdfn) spowodowana czynnikiem rh, inaczej choroba rh lub choroba rhesusowa – Diagnostyka i diagnoza

Choroba hemolityczna płodu i noworodka (HDFN) wywołana niezgodnością czynnika Rh, najczęściej w sytuacji matki Rh-ujemnej i płodu Rh-dodatniego, jest wynikiem immunologicznej destrukcji erytrocytów płodu przez przeciwciała matczyne anty-Rh(D). Diagnostyka rozpoczyna się od rutynowego typowania grupy krwi i czynnika Rh u ciężarnej oraz przesiewowego badania obecności przeciwciał anty-Rh(D). W przypadku wykrycia przeciwciał, monitoruje się ich miano (zwykle krytyczne wartości mieszczą się w zakresie 1:8 do 1:32) oraz wykonuje nieinwazyjne badania prenatalne, takie jak NIPT do określenia statusu Rh płodu (czułość 99,9%, swoistość 99,1%) oraz ultrasonografię z oceną przepływu w tętnicy środkowej mózgu (MCA Doppler) w celu wykrycia anemii płodu. W razie podejrzenia ciężkiej anemii stosuje się inwazyjne procedury diagnostyczne, takie jak kordocenteza (PUBS) i amniocenteza, umożliwiające ocenę stężenia bilirubiny, obecności przeciwciał i niedokrwistości, a także ewentualne wewnątrzmaciczne transfuzje krwi.
alloimmunizacja, amniocenteza, antygen RhD, autoimmunologiczna niedokrwistość hemolityczna, badanie dopplerowskie, badanie prenatalne, choroba hemolityczna płodu i noworodka, choroba Rh, choroba rhesusowa, czynnik Rh, grupa krwi, hematokryt, hiperbilirubinemia, immunoglobulina anty-D, immunoglobulina Rh, kordocenteza, krew Rh-ujemna, krwawienie płodowo-matczyne, metoda PCR, nieinwazyjne badanie prenatalne, obrzęk uogólniony płodu, poziom bilirubiny, preimplantacyjna diagnostyka genetyczna, retikulocyt, test Coombsa, test Kleihauera-Betke, test point-of-care, transfuzja wymienna, ultrasonografia, wolne DNA płodowe, żółtaczka, zygotyczność