polimorfizm pojedynczego nukleotydu
Polimorfizm pojedynczego nukleotydu (SNP, ang. Single Nucleotide Polymorphism) to najczęstszy rodzaj zmienności genetycznej, polegający na zamianie pojedynczego nukleotydu w sekwencji DNA. Aby wariant genetyczny został sklasyfikowany jako SNP, musi występować w populacji z częstością co najmniej 1%.
SNP mogą znajdować się w regionach kodujących (eksonach), gdzie mogą zmieniać sekwencję aminokwasów w białku, lub w regionach niekodujących (intronach), gdzie mogą wpływać na regulację ekspresji genów. Szczególnie istotne są SNP typu missense, które prowadzą do podstawienia innego aminokwasu w łańcuchu białkowym, oraz SNP nonsense, które wprowadzają przedwczesny kodon stop.
W medycynie polimorfizmy pojedynczego nukleotydu mają duże znaczenie diagnostyczne i prognostyczne. Służą jako markery genetyczne w badaniach asocjacyjnych całego genomu (GWAS), pomagając identyfikować genetyczne podłoże chorób złożonych. SNP są również wykorzystywane w farmakogenetyce do przewidywania odpowiedzi pacjentów na leki oraz w medycynie spersonalizowanej.
Identyfikacja SNP jest możliwa dzięki technologiom sekwencjonowania DNA, mikromacierzom SNP oraz technikom opartym na reakcji PCR. Bazy danych takie jak dbSNP gromadzą informacje o znanych polimorfizmach i ich potencjalnym znaczeniu klinicznym, co ułatwia lekarzom interpretację wyników badań genetycznych.
Powiązane wpisy
- Leksykon chorób i schorzeń
Zaburzenie somatyczne – Patofizjologia i mechanizm
Zaburzenie somatyczne (SSD) charakteryzuje się nadmierną świadomością doznań cielesnych i ich interpretacją jako objawów choroby somatycznej. Patogeneza jest wieloczynnikowa, obejmując zmiany w autonomicznym układzie nerwowym (np. tachykardia, wzmożona motoryka żołądka, napięcie mięśniowe), zmiany strukturalne i funkcjonalne mózgu (m.in. zmniejszona objętość ciała migdałowatego, zmieniona łączność z obszarami wykonawczymi i motorycznymi), a także procesy prozapalne. Genetyczny wkład w objawy somatyczne wynosi 7-21%, z udziałem polimorfizmów pojedynczego nukleotydu, szczególnie w układzie monoaminergicznym. Kluczowym mechanizmem jest zaburzona percepcja somatosensoryczna i interocepcja, nasilona przez negatywne czynniki psychologiczne, takie jak katastrofizacja, negatywna afektywność i unikanie behawioralne. Zaburzenie somatyczne często współwystępuje z zaburzeniami lękowymi, depresyjnymi oraz zespołem jelita drażliwego i przewlekłym bólem, a także jest powiązane z traumą i stresem psychospołecznym.
autonomiczny układ nerwowy, centralna sensytyzacja, ciało migdałowate, fibromialgia, katastrofizacja bólu, lęk o zdrowie, model biopsychospołeczny, motoryka żołądka, napięcie mięśniowe, negatywna afektywność, oś podwzgórze-przysadka-nadnercza, ośrodkowy układ nerwowy, polimorfizm pojedynczego nukleotydu, proces prozapalny, przetwarzanie emocjonalne, przewlekła obturacyjna choroba płuc, tachykardia, terapia oparta na uważności, terapia poznawczo-behawioralna, układ monoaminergiczny, zaburzenie konwersyjne, zaburzenie somatyczne, zespół jelita drażliwego, zespół stresu pourazowego, zmienność rytmu serca - Leksykon chorób i schorzeń
Chordoma – Patofizjologia i mechanizm
Chordoma to rzadki, pierwotny złośliwy nowotwór kości wywodzący się z pozostałości struny grzbietowej, charakteryzujący się nadekspresją czynnika transkrypcyjnego brachyury (kodowanego przez gen TBXT). Duplikacje TBXT występują w 44% rodzinnych i amplifikacje w 27% sporadycznych przypadków. Patogeneza obejmuje aktywację szlaków sygnałowych FGF/MEK/ERK, PI3K/AKT/mTOR (z fosforylacją białek Akt, TSC2 i EIF4EBP1 odpowiednio w 92%, 96% i 98% przypadków) oraz receptorów tyrozynowych EGFR, PDGFR (obecny w 100% przypadków) i c-Met. Utrata genów supresorowych CDKN2A (p16/p15) w 30% i PTEN w 80% przypadków, a także delecje SMARCB1 w podtypie słabo zróżnicowanym, sprzyjają progresji choroby. Epigenetyczne mechanizmy, takie jak hipermetylacja DNA i dysregulacja miRNA (np. ADAR1 wpływający na miR-10a i miR-125a), również odgrywają rolę w patogenezie.
biologia molekularna, cykl komórkowy, czynnik transkrypcyjny, czynnik transkrypcyjny brachyury, czynnik wzrostu fibroblastów, deaminaza adenozyny, duplikacja genu, embriogeneza, gen TBXT, hipermetylacja DNA, inhibitor mTOR, kariotyp, komórki macierzyste, metylacja DNA, mikroRNA, mTOR, niestabilność chromosomowa, nowotwór złośliwy, polimorfizm pojedynczego nukleotydu, przejście nabłonkowo-mezenchymalne, receptor czynnika wzrostu naskórka, receptor płytkopochodnego czynnika wzrostu, receptorowa kinaza tyrozynowa, struna grzbietowa, szlak PI3K/AKT/mTOR, szlak Sonic Hedgehog, terapia molekularna, wyspa CpG, złośliwy nowotwór kości