wyspa CpG
Wyspa CpG (ang. CpG island) to region DNA bogaty w sekwencje cytozyna-guanina połączone wiązaniem fosfodiestorowym (oznaczane jako CpG). Charakteryzują się one wysoką zawartością par CG (powyżej 55%) oraz długością przekraczającą 200 par zasad. Termin „wyspa” odnosi się do faktu, że sekwencje te występują jako wyraźnie wyodrębnione fragmenty w genomie, gdzie ogólna częstość występowania dinukleotydów CpG jest stosunkowo niska.
Wyspy CpG mają kluczowe znaczenie w regulacji ekspresji genów. Około 60-70% ludzkich promotorów genów zawiera wyspy CpG, co czyni je istotnym elementem kontrolującym aktywność transkrypcyjną. W normalnych komórkach somatycznych wyspy CpG w regionach promotorowych są zazwyczaj niezmetylowane, co umożliwia ekspresję powiązanych genów. Metylacja tych obszarów prowadzi do wyciszenia transkrypcji.
W kontekście patologii, nieprawidłowa metylacja wysp CpG odgrywa istotną rolę w rozwoju chorób, szczególnie nowotworów. Hipermetylacja wysp CpG w regionach promotorowych genów supresorowych może prowadzić do ich inaktywacji, co sprzyja procesowi kancerogenezy. Z kolei globalna hipometylacja genomu, w tym regionów zawierających wyspy CpG, może prowadzić do niestabilności chromosomowej i nieprawidłowej ekspresji onkogenów.
Powiązane wpisy
- Leksykon chorób i schorzeń
Mięsak stawowy – Patofizjologia i mechanizm
Mięsak stawowy (synovial sarcoma) to złośliwy nowotwór tkanek miękkich, stanowiący 5-10% mięsaków, charakteryzujący się patognomoniczną translokacją t(X;18)(p11.2;q11.2) obecna w ponad 90% przypadków. Translokacja ta prowadzi do powstania białek fuzyjnych SS18-SSX, które modyfikują funkcję kompleksu remodelującego chromatynę SWI/SNF (BAF), wypierając supresorowe białko BAF47 i aktywując ekspresję genu Sox2, kluczowego dla proliferacji komórek nowotworowych. Białka fuzyjne działają jako nieprawidłowe regulatory transkrypcji, zaburzając równowagę między kompleksami Trithorax (TrxG) a Polycomb (PcG), co prowadzi do epigenetycznej deregulacji i aktywacji onkogenów oraz zahamowania genów supresorowych. Wyróżnia się podtypy molekularne mięsaka stawowego (SSC-I, SSC-II, SSC-III) o różnym rokowaniu, a obecność fuzji SS18-SSX1 koreluje z gorszym przeżyciem i agresywniejszym fenotypem guza.
aberracja cytogenetyczna, błona maziowa stawu, dehydroepiandrosteron, dehydrogenaza glukozo-6-fosforanowa, gen Sox2, gen SS18, gen SSX, infiltracja limfocytów, inhibitor deacetylazy histonowej, inhibitor punktów kontrolnych, komórka mezenchymalna, kompleks remodelujący chromatynę, kompleks SWI/SNF, mechanizm epigenetyczny, mięsak stawowy, nowotwór tkanek miękkich, onkogen BCL-2, podtyp molekularny, proliferacja komórek, receptor czynnika wzrostu, szlak sygnałowy, transformacja nowotworowa, translokacja chromosomowa, wyspa CpG - Leksykon chorób i schorzeń
Chordoma – Patofizjologia i mechanizm
Chordoma to rzadki, pierwotny złośliwy nowotwór kości wywodzący się z pozostałości struny grzbietowej, charakteryzujący się nadekspresją czynnika transkrypcyjnego brachyury (kodowanego przez gen TBXT). Duplikacje TBXT występują w 44% rodzinnych i amplifikacje w 27% sporadycznych przypadków. Patogeneza obejmuje aktywację szlaków sygnałowych FGF/MEK/ERK, PI3K/AKT/mTOR (z fosforylacją białek Akt, TSC2 i EIF4EBP1 odpowiednio w 92%, 96% i 98% przypadków) oraz receptorów tyrozynowych EGFR, PDGFR (obecny w 100% przypadków) i c-Met. Utrata genów supresorowych CDKN2A (p16/p15) w 30% i PTEN w 80% przypadków, a także delecje SMARCB1 w podtypie słabo zróżnicowanym, sprzyjają progresji choroby. Epigenetyczne mechanizmy, takie jak hipermetylacja DNA i dysregulacja miRNA (np. ADAR1 wpływający na miR-10a i miR-125a), również odgrywają rolę w patogenezie.
biologia molekularna, cykl komórkowy, czynnik transkrypcyjny, czynnik transkrypcyjny brachyury, czynnik wzrostu fibroblastów, deaminaza adenozyny, duplikacja genu, embriogeneza, gen TBXT, hipermetylacja DNA, inhibitor mTOR, kariotyp, komórki macierzyste, metylacja DNA, mikroRNA, mTOR, niestabilność chromosomowa, nowotwór złośliwy, polimorfizm pojedynczego nukleotydu, przejście nabłonkowo-mezenchymalne, receptor czynnika wzrostu naskórka, receptor płytkopochodnego czynnika wzrostu, receptorowa kinaza tyrozynowa, struna grzbietowa, szlak PI3K/AKT/mTOR, szlak Sonic Hedgehog, terapia molekularna, wyspa CpG, złośliwy nowotwór kości