chromotripsja
Chromotripsja to zjawisko genetyczne charakteryzujące się licznymi, chaotycznymi rearanżacjami chromosomowymi, które powstają podczas pojedynczego katastrofalnego wydarzenia w komórce. Termin ten pochodzi od greckich słów „chromos” (chromosom) i „thripsis” (kruszenie), co obrazowo oddaje naturę tego procesu – chromosomy ulegają „skruszeniu” na dziesiątki lub setki fragmentów, które następnie zostają nieprawidłowo połączone przez mechanizmy naprawy DNA.
Zjawisko to zostało po raz pierwszy opisane w 2011 roku przez naukowców z Instytutu Wellcome Sanger. W przeciwieństwie do stopniowo gromadzących się mutacji, chromotripsja zachodzi nagle, prowadząc do masowych zmian genomowych w jednym wydarzeniu komórkowym. Charakterystyczne cechy chromotripsji to ograniczenie zmian do jednego lub kilku chromosomów, oscylujący wzór liczby kopii DNA między jednym a dwoma stanami oraz losowe połączenie fragmentów chromosomowych.
Chromotripsja jest obserwowana w różnych typach nowotworów, w tym w nowotworach kości, mózgu, białaczkach oraz guzach litych. Badania wskazują, że zjawisko to może być inicjującym wydarzeniem w procesie nowotworzenia, wprowadzając dramatyczne zmiany genomowe, które mogą aktywować onkogeny lub inaktywować geny supresorowe. Oprócz nowotworów, chromotripsja została zidentyfikowana w niektórych wrodzonych zaburzeniach rozwojowych.
Mechanizmy prowadzące do chromotripsji nie są w pełni poznane, ale sugeruje się rolę błędów podczas mitozy, formowania mikrojąder, zaburzeń w procesie apoptozy czy ekspozycji na promieniowanie jonizujące. Identyfikacja chromotripsji ma znaczenie diagnostyczne i prognostyczne, szczególnie w onkologii, gdzie może wpływać na agresywność nowotworu i odpowiedź na terapię.
Powiązane wpisy
- Leksykon chorób i schorzeń
Neuroblastoma – Patofizjologia i mechanizm
Neuroblastoma to złośliwy nowotwór wywodzący się z komórek grzebienia nerwowego obwodowego układu współczulnego, stanowiący około 8% nowotworów złośliwych u dzieci. Rokowanie zależy od stopnia zróżnicowania guza, z gorszymi wynikami u pacjentów z prymitywnymi formami. Genetycznie neuroblastoma dzieli się na grupy z niemal diploidalną (45%) i triploidalną (55%) zawartością DNA. Amplifikacja onkogenu MYCN, obecna u 20-25% pacjentów, koreluje z agresywnym przebiegiem choroby. Mutacje aktywujące kinazę ALK oraz mutacje linii zarodkowej genu PHOX2B są kluczowymi czynnikami patogenezy, szczególnie w rodzinnych przypadkach. Najczęstsze aberracje genetyczne to zysk chromosomu 17q (≥80% przypadków), delecje 1p36 (25-35%) i 11q, które wiążą się z gorszym rokowaniem i zaawansowanym stadium choroby. Epigenetyczne zmiany, w tym hipometylacja genów takich jak CCND1, oraz dysregulacja niekodujących RNA (np. miR-137, miR-152, miR-495) odgrywają istotną rolę w patogenezie i różnicowaniu neuroblastoma.
aberracja chromosomowa, angiogeneza, białko p53, chromotripsja, cytokiny, czynnik wzrostu nerwów, delecja 11q, edycja genów, embriogeneza, EZH2, grzebień nerwowy, guz pozaczaszkowy, heterogenność kliniczna, hipermetylacja, hipometylacja, immunoterapia nowotworów, kinaza chłoniaka anaplastycznego, kinaza tyrozynowa, komórki macierzyste nowotworowe, kwas retinowy, metylacja DNA, metylacja histonów, miRNA, neuroblast, neuroblastoma, niekodujące RNA, PHOX2B, receptor CXCR4, rokowanie, sekwencjonowanie DNA, TGF-β, transformacja nabłonkowo-mezenchymalna, układ nerwowy współczulny - Leksykon chorób i schorzeń
Ependymoma – Patofizjologia i mechanizm
Ependymoma to nowotwór OUN o zróżnicowanym pochodzeniu komórkowym, obejmującym komórki glejowe promieniste (RGCs) oraz dojrzałe komórki ependymalne, co zależy od lokalizacji anatomicznej guza. Molekularne profile ependymoma różnią się istotnie: ependymoma nadnamiotowe często wykazują fuzję ZFTA::RELA (około 70% przypadków) z aktywacją szlaku NF-κB i niekorzystnym rokowaniem, podczas gdy fuzja YAP1 wiąże się z lepszym prognozą. Ependymoma tylnego dołu czaszki dzielą się na podtypy PF-A i PF-B, z których PF-A charakteryzuje się ekspresją EZHIP, niskim poziomem metylacji H3K27me3 oraz zyskiem chromosomu 1q, co koreluje z gorszym przeżyciem. W ependymoma rdzenia kręgowego często obserwuje się amplifikację MYCN oraz mutacje NF2, co wiąże się z agresywnym przebiegiem choroby. Kluczowe zmiany genetyczne obejmują delecję 22q12.3-22q13.33, amplifikację 1q21.1-32.1, a także mutacje i fuzje genowe specyficzne dla lokalizacji guza. Indeks proliferacyjny Ki-67 >7% stanowi istotny marker złośliwości.
aberracje chromosomowe, amplifikacja MYCN, chromotripsja, delecja CDKN2A, delecja chromosomu, ependymoma nadnamiotowe, ependymoma rdzenia kręgowego, ependymoma śluzowo-brodawkowate, ependymoma tylnego dołu czaszki, fuzja ZFTA-RELA, hipoksja, indeks Ki-67, kanał centralny rdzenia kręgowego, komórki ependymalne, komórki macierzyste nowotworowe, komórki progenitorowe, kompleks PRC2, mechanizmy epigenetyczne, metylacja DNA, modyfikacje histonów, nerwiakowłókniakowatość typu 1, nerwiakowłókniakowatość typu 2, nowotwór ośrodkowego układu nerwowego, onkogen MYCN, sekwencjonowanie RNA, szlak Hippo, szlak NF-κB, szlak Notch, szlak PI3K, szlak Sonic Hedgehog, układ komorowy mózgu, zespół Li-Fraumeni, zespół Turcota