cyfrowy PCR
Cyfrowy PCR (dPCR – digital Polymerase Chain Reaction) to zaawansowana metoda molekularna, będąca udoskonaleniem klasycznego PCR, umożliwiająca precyzyjną kwantyfikację kwasów nukleinowych. Technika ta polega na podziale próbki na tysiące lub miliony mikrokomorek, z których każda zawiera albo pojedynczą cząsteczkę DNA, albo jej nie zawiera, co pozwala na bezwzględny pomiar liczby kopii docelowej sekwencji.
W przeciwieństwie do ilościowego PCR w czasie rzeczywistym (qPCR), cyfrowy PCR nie wymaga standardowej krzywej kalibracyjnej, co zwiększa jego dokładność i powtarzalność. Metoda ta charakteryzuje się wyjątkową czułością, umożliwiając wykrywanie rzadkich sekwencji i mutacji z częstością występowania nawet poniżej 0,1%, co ma kluczowe znaczenie w diagnostyce onkologicznej czy monitorowaniu choroby resztkowej.
Zastosowania kliniczne cyfrowego PCR obejmują wykrywanie mutacji nowotworowych z płynnej biopsji, analizę wolnego pozakomórkowego DNA płodowego, diagnostykę chorób zakaźnych oraz monitorowanie odrzucania przeszczepów. Technologia ta znajduje również zastosowanie w badaniach nad biomarkerami, walidacji edycji genów oraz precyzyjnej analizie ekspresji genów.
Powiązane wpisy
- Leksykon chorób i schorzeń
Zespół mielodysplastyczny – Epidemiologia
Zespół mielodysplastyczny (MDS) to heterogenna grupa klonalnych nowotworów hematopoetycznych charakteryzujących się nieskuteczną hematopoezą i cytopeniami, z ryzykiem progresji do ostrej białaczki szpikowej (AML) u 30-40% pacjentów. Zapadalność MDS w USA wynosi około 4-4,9 na 100 000 osób rocznie, jednak rzeczywiste wartości mogą sięgać 5,3-13,1/100 000 z powodu niedodiagnozowania i niedostatecznego zgłaszania. Mediana wieku w chwili rozpoznania to 70-76 lat, a zapadalność rośnie znacząco z wiekiem, osiągając 20,8-36,3/100 000 u osób powyżej 70 lat. Mężczyźni są dwukrotnie bardziej narażeni niż kobiety, z wyjątkiem MDS z delecją 5q, częściej występującego u kobiet. Rasa biała wykazuje wyższy wskaźnik zachorowalności (0,03%) w porównaniu do innych grup etnicznych (0,02%). Chorobowość w USA szacuje się na 60 000-170 000 pacjentów, a globalnie przewiduje się wzrost liczby przypadków z 90 332 w 2018 do 111 861 w 2028 roku (roczny wzrost 2,38%).
aktywne monitorowanie, allogeniczne przeszczepienie krwiotwórczych komórek macierzystych, całkowite przeżycie, cyfrowy PCR, cytopenia, hematopoeza, IPSS-M, IPSS-R, jakość życia związana ze zdrowiem, klonalna hematopoeza, morfologia krwi, niedodiagnozowanie, ostra białaczka szpikowa, przeżycie wolne od nawrotu, remisja, sekwencjonowanie nowej generacji, wariant zarodkowy, zespół mielodysplastyczny - Leksykon chorób i schorzeń
Cytomegalowirus – Diagnostyka i diagnoza
Cytomegalowirus (CMV) jest powszechnym wirusem z rodziny Herpesviridae, stanowiącym główną przyczynę zakażeń wrodzonych oraz istotne zagrożenie dla pacjentów z obniżoną odpornością. Diagnostyka CMV opiera się na metodach serologicznych (IgM, IgG, awidność IgG), molekularnych (PCR jakościowy, ilościowy qPCR, cyfrowy dPCR), wykrywaniu antygenu pp65 oraz hodowli wirusa. PCR ilościowy w czasie rzeczywistym jest preferowaną metodą monitorowania wiremii u biorców przeszczepów, natomiast test pp65 służy do szybkiego wykrywania aktywnego zakażenia. Wrodzone zakażenie CMV diagnozuje się na podstawie wykrycia wirusa w moczu lub ślinie noworodka w ciągu pierwszych 3 tygodni życia, z PCR śliny jako testem przesiewowym i potwierdzającym testem z moczu. Serologia jest ograniczona w diagnostyce wrodzonego zakażenia. U pacjentów immunosupresyjnych PCR ilościowy z osocza lub krwi pełnej jest podstawowym narzędziem diagnostycznym, umożliwiającym wczesne wykrycie i monitorowanie terapii przeciwwirusowej. Histopatologia z wykryciem charakterystycznych wtrętów „sowiego oka” potwierdza zajęcie narządów przez CMV.
antygen wirusowy, badanie histopatologiczne, badanie serologiczne, cyfrowy PCR, cytomegalowirus, czuciowo-nerwowa utrata słuchu, gancyklowir, Herpesviridae, hodowla wirusa, hybrydyzacja in situ, kwas nukleinowy wirusa, metoda molekularna, PCR w czasie rzeczywistym, przeciwciała IgG, przeciwciała IgM i IgG, przeszczep narządów miąższowych, przeszczep szpiku kostnego, reakcja łańcuchowa polimerazy, sekwencjonowanie całego genomu, test awidności IgG, test ELISA, test immunofluorescencyjny, walgancyklowir, wrodzone zakażenie CMV, wtrąt wewnątrzjądrowy, zakażenie wrodzone, zapalenie jelita grubego, zapalenie płuc CMV, zapalenie siatkówki, zapalenie żołądka i jelit - Leksykon chorób i schorzeń
Przewlekła białaczka szpikowa – Rokowania, prognozy i postęp choroby
Wprowadzenie inhibitorów kinazy tyrozynowej (TKI) zrewolucjonizowało leczenie przewlekłej białaczki szpikowej (CML), znacząco poprawiając rokowanie pacjentów, z 5-letnim przeżyciem sięgającym około 90%, a u osób poniżej 60 roku życia przekraczającym 90%. Pomimo tego, u części pacjentów dochodzi do progresji choroby do fazy akceleracji (AP) i blastycznej (BP), gdzie mediana przeżycia wynosi mniej niż rok, zwłaszcza bez możliwości allogenicznego przeszczepu komórek macierzystych. Kluczowe czynniki prognostyczne obejmują wiek, fazę choroby, status chromosomu Philadelphia, wielkość śledziony, liczbę płytek krwi, obecność dodatkowych aberracji chromosomowych (ACA) oraz poziom blastów i hemoglobiny. W praktyce klinicznej stosuje się wskaźniki prognostyczne, takie jak Sokal, EUTOS i ELTS, z których ELTS wykazuje najwyższą wartość prognostyczną, przewidując ryzyko zgonu związanego z CML na poziomie 2%, 15% i 40% dla niskiego, pośredniego i wysokiego ryzyka odpowiednio w ciągu 10 lat.
aberracja chromosomowa, allogeniczny przeszczep komórek macierzystych, chromosom Philadelphia, cyfrowy PCR, czynnik predykcyjny, faza akceleracji, faza blastyczna, faza przewlekła, głęboka odpowiedź molekularna, inhibitor kinazy tyrozynowej, mutacja punktowa, niestabilność genetyczna, odpowiedź molekularna, przewlekła białaczka szpikowa, remisja wolna od leczenia, wskaźnik ELTS, wskaźnik EUTOS, wskaźnik Sokala - Leksykon chorób i schorzeń
Infekcja wirusem cytomegalii – Diagnostyka i diagnoza
Infekcja wirusem cytomegalii (CMV) jest istotnym problemem klinicznym, szczególnie u noworodków z zakażeniem wrodzonym oraz u pacjentów z upośledzoną odpornością. Diagnostyka CMV opiera się na metodach serologicznych (ocena przeciwciał IgG, IgM oraz awidności IgG), molekularnych (PCR jakościowy, ilościowy i cyfrowy dPCR), testach antygenemii pp65 oraz klasycznych metodach hodowlanych i badaniach histopatologicznych. W diagnostyce prenatalnej złotym standardem jest PCR płynu owodniowego, wykonywany po 21. tygodniu ciąży, z czułością 78-98% i swoistością 92-98%. U noworodków do potwierdzenia zakażenia wrodzonego stosuje się PCR śliny i moczu pobranych w ciągu pierwszych 3 tygodni życia. Monitorowanie wiremii CMV za pomocą ilościowego PCR jest kluczowe w ocenie przebiegu zakażenia i odpowiedzi na leczenie, zwłaszcza u pacjentów po przeszczepach oraz u noworodków z objawowym zakażeniem.
amniocenteza, cidofowir, cyfrowy PCR, foskarnet, gancyklowir, hodowla komórkowa, hybrydyzacja in situ, infekcja wirusem cytomegalii, kwas nukleinowy, lek przeciwwirusowy, metoda immunohistochemiczna, niedosłuch czuciowo-nerwowy, oporność na leki, płyn owodniowy, płyn ustrojowy, przeciwciało anty-CMV, przeciwciało klasy IgG, przeciwciało klasy IgM, reakcja łańcuchowa polimerazy, serokonwersja, sucha kropla krwi, test awidności IgG, test ELISA, test serologiczny, walgancyklowir, wiremia, wrodzone zakażenie CMV, zakażenie CMV, zapalenie jelita grubego, zapalenie płuc, zapalenie przełyku, zapalenie siatkówki