Choroba zapalna jelit
Rokowania, prognozy i postęp choroby

Choroby zapalne jelit (IBD), obejmujące chorobę Leśniowskiego-Crohna (CD) oraz wrzodziejące zapalenie jelita grubego (UC), charakteryzują się heterogenicznością fenotypową i kliniczną, co utrudnia skuteczne zarządzanie terapią. Obecnie brak jest zwalidowanych biomarkerów prognostycznych i predykcyjnych, które pozwalałyby na precyzyjne prognozowanie przebiegu choroby oraz odpowiedzi na leczenie. Standardowe wskaźniki, takie jak białko C-reaktywne (CRP) i kalprotektyna kałowa (FC), są użyteczne w monitorowaniu aktywności choroby, jednak ich czułość i swoistość są ograniczone. Zaawansowane techniki obrazowania, w tym ultrasonografia jelitowa (IUS) oraz enterografia rezonansu magnetycznego (MRE), wykazują potencjał w ocenie aktywności choroby i przewidywaniu odpowiedzi na terapię, choć wymagają dalszej walidacji. Nowatorskie podejścia, takie jak radiomika oraz analiza czynników transkrypcyjnych (TF), oferują obiecujące możliwości identyfikacji złożonych biomarkerów, które mogą lepiej odzwierciedlać dynamikę molekularną i kliniczną IBD.

Wprowadzenie do prognozy IBD

Choroby zapalne jelit (IBD) to przewlekłe schorzenia powodujące nawracające zapalenie jelit. Ze względu na brak możliwości wyleczenia, kliniczne zarządzanie IBD jest niezwykle trudne, ponieważ choroby te prezentują szeroki zakres fenotypów i zachowań chorobowych. Istnieje pilna potrzeba opracowania markerów, które mogłyby pomóc lekarzom w wyborze odpowiedniej opcji leczenia spośród szybko rosnącej liczby dostępnych terapii, co umożliwiłoby spersonalizowaną opiekę i poprawę ogólnych wyników leczenia1. Rozwój biomarkerów prognostycznych jest szczególnie skomplikowany z powodu braku powszechnie akceptowanej i/lub zwalidowanej skali oceny wyników choroby. Definiowanie wyniku choroby w IBD jest dalekie od oczywistego, biorąc pod uwagę szeroki zakres czynników organicznych i nieorganicznych wpływających na zdrowie i samopoczucie pacjenta1.

IBD było kiedyś uważane za dychotomiczną grupę chorób – pacjenci cierpieli albo na chorobę Leśniowskiego-Crohna (CD), albo na wrzodziejące zapalenie jelita grubego (UC) i byli odpowiednio leczeni. Odkrycia genetyczne zakwestionowały ten tradycyjny pogląd, prowadząc do zrozumienia IBD jako heterogennego stanu z szeregiem subfenotypów o różnym stopniu ciężkości i odpowiedzi na różne rodzaje leczenia1. Aby odzwierciedlić rzeczywistość leczonych chorób, należy szybciej i bardziej systematycznie przechodzić w kierunku podejścia medycyny precyzyjnej1.

Wyzwania w prognozowaniu przebiegu IBD

Opracowanie markerów molekularnych zdolnych do przewidywania wyników lub odpowiedzi na leczenie u pacjentów z IBD jest dalekie od trywialnego z wielu powodów1. Biorąc pod uwagę oczekiwaną różnorodność IBD i zakładając, że prawidłowy biomarker prognostyczny jest istotny dla patogenezy choroby, ponieważ wariacje mogą wyjaśniać różnice w zachowaniu choroby, wydaje się mało prawdopodobne, aby pojedynczy marker mógł być stosowany u wszystkich pacjentów1. Rozwój biomarkerów prognostycznych w IBD był utrudniony przez brak istniejących, wymiernych, zwalidowanych miar wyników. Co ważne, prognoza choroby nie przewiduje odpowiedzi na konkretną terapię w IBD1.

Obecnie nie ma przekonujących dowodów na istnienie parametrów klinicznych w momencie rozpoznania, które mogłyby przewidzieć przyszły wynik choroby u pacjentów z CD1. Krótkoterminowa odpowiedź na leczenie jest znaczącym punktem końcowym, ale badania wykazały, że nie koreluje ona z przyszłymi wskaźnikami uszkodzenia tkanek i przebudowy1. Zwalidowane biomarkery predykcyjne do określenia przyszłego przebiegu choroby są praktycznie nieobecne we wszystkich głównych obszarach IBD1.

Aktualne podejścia do prognozy IBD

Markery kliniczne i laboratoryjne

W obecnej praktyce klinicznej większość prognozowania opiera się na zmiennych klinicznych uzupełnionych tradycyjnym monitorowaniem laboratoryjnym, takim jak białko C-reaktywne (CRP) i kalprotektyna kałowa (FC)1. Czynniki kliniczne zostały zidentyfikowane w licznych retrospektywnych analizach zarówno choroby Leśniowskiego-Crohna, jak i wrzodziejącego zapalenia jelita grubego, aby przewidzieć przebieg choroby1.

Podwyższony poziom CRP w momencie diagnozy został powiązany z późniejszą potrzebą operacji zarówno w CD, jak i UC1. Seryjne pomiary wykazały zdolność do przewidywania progresji choroby i/lub nawrotu1. Wartość kliniczna testów kalprotektyny kałowej w diagnostyce i ocenie endoskopowej aktywności choroby IBD została udowodniona1.

Techniki obrazowania w prognozowaniu

Obrazowanie przekrojowe, w tym ultrasonografia jelitowa (IUS), obrazowanie metodą rezonansu magnetycznego (MRI), a dokładniej enterografia rezonansu magnetycznego (MRE) i enterografia tomografii komputerowej (CTE), są niezbędnymi narzędziami do monitorowania aktywności choroby i wczesnego wykrywania oznak odpowiedzi lub niepowodzenia terapii biologicznych1. Badania zaczęły badać użyteczność obrazowania przekrojowego nie tylko w monitorowaniu, ale także w przewidywaniu odpowiedzi na leczenie farmakologiczne1.

IUS wykazuje wysoką dokładność w wykrywaniu gojenia śluzówki, pokazując wysoką zgodność z MRE i gojeniem błony śluzowej1. W dużym, prospektywnym badaniu obserwacyjnym, Allocca i współpracownicy przeprowadzili IUS w kohorcie 225 pacjentów z CD, aby zbadać rolę IUS w przewidywaniu 12-miesięcznego przebiegu choroby1. W ciągu ostatnich kilku lat uwaga badaczy skupiła się na zdolności IUS do określania wczesnej odpowiedzi na leczenie1.

W kontekście MRE, nowe techniki oparte na MRE mogą być obiecujące, szczególnie transfer magnetyzacji (MT) i MRI ruchomości (mMRI)1. Główne cechy MRE i DWI odzwierciedlające aktywną chorobę i przewidujące odpowiedź terapeutyczną są istotne w praktyce klinicznej1.

Zaawansowane techniki i radiomika

Obiecujące perspektywy pochodzą z zaawansowanych technologii, a mianowicie radiomiki1. W badaniu pilotażowym, naukowcy po raz pierwszy wykazali rolę radiomiki w przewidywaniu ryzyka operacji w ciągu dziesięciu lat w kohorcie pacjentów z CD1. Jednakże, obecnie istnieją tylko dwa badania na temat roli radiomiki w przewidywaniu odpowiedzi na leczenie1.

Zarówno IUS, jak i MRE wydają się szczególnie obiecujące, a różne parametry zostały zidentyfikowane jako potencjalne markery predykcyjne1. Jednak dane dotyczące możliwych markerów predykcyjnych są niedawne i wymagają wdrożenia i walidacji1. Potrzebne są dalsze badania, aby obrazowanie przekrojowe stało się wiarygodnym przewodnikiem dla lekarzy IBD dążących do identyfikacji najlepszego algorytmu terapeutycznego1.

Nowe podejścia i przyszłe kierunki

Podejście medycyny systemowej

Biologia systemowa zapewnia nieuprzedzone podejście do radzenia sobie z wariancją zarówno w danych omicznych, jak i klinicznych i została z powodzeniem wykorzystana do opracowania biomarkerów prognostycznych w innych chorobach1. Rozwój biomarkerów predykcyjnych choroby może zapewnić bardziej realistyczną i równie korzystną alternatywę1.

Medycyna systemowa oferuje wyrafinowane podejście do badania nie tylko złożonych interakcji molekularnych i komórkowych, ale także pozwala na holistyczną, systematyczną i nieuprzedzoną analizę zintegrowanych wysokoprzepustowych danych omicznych z zestawami danych klinicznych1.

Tradycyjne badania predykcyjne nie uwzględniają naszego postępującego zrozumienia patogenezy IBD, co wymaga podejścia biologii systemowej, które pozwala nam integrować analizy indywidualnych -omów w całościowy wynik, który jest większy niż suma jego części1. Celem końcowym jest zwalidowany biomarker śluzówkowy, który może informować o decyzjach dotyczących leczenia i definiować populacje badań klinicznych1.

Markery molekularne i genetyczne

Aby rozwiązać ten problem, niektórzy badacze skoncentrowali się na markerach opartych na czynnikach transkrypcyjnych (TF), ponieważ dokładnie reprezentują one dynamiczne mechanizmy regulacyjne, które kontrolują ekspresję genów związanych z chorobą. Są one bardziej czułe i informatywne do śledzenia rozwoju choroby, skuteczności terapii i podejść medycyny spersonalizowanej, ponieważ zbierają informacje w czasie rzeczywistym o reakcji komórki na zmieniające się warunki, w przeciwieństwie do statycznych markerów genowych1.

Zmiana poziomu ekspresji jednego TF wpłynie na sieć setek genów powiązanych z chorobą1. Podejście in-silico zostało wykorzystane do potwierdzenia roli wybranych TF w rozwoju IBD i jego progresji poprzez eksplorację biologicznych baz danych, takich jak ONCOMINE, TCGA i Gene Expression Atlas1.

Kombinacja RUNX1 z czterema dodatkowymi biomarkerami, a mianowicie SPIB, ELF5, SPI1 i FEV, zwiększyła dokładność diagnostyczną, wykazując czułość 99% i swoistość 95%1. Biorąc pod uwagę ograniczenia każdego z tych biomarkerów indywidualnie, można stwierdzić, że żaden z tych markerów nie może być używany w izolacji do dokładnego przewidywania progresji IBD do CRC, a badania sugerują, że połączenie tych biomarkerów ma potencjał znacznej poprawy dokładności diagnostycznej1.

Podejścia multi-omiczne

Prospektywne, wieloośrodkowe badanie obserwacyjne IBD-RESPONSE ma na celu identyfikację i walidację modelu predykcyjnego odpowiedzi na zaawansowane terapie IBD, uwzględniającego mikrobiom jelitowy, metabolom, transkryptom pojedynczych komórek, ludzki genom, dane dietetyczne i kliniczne1. Głównym celem naukowym IBD-RESPONSE jest identyfikacja i walidacja modelu predykcyjnego odpowiedzi klinicznej lub niepowodzenia odpowiedzi na zaawansowane terapie w IBD po 14 tygodniach terapii1.

Absolutne znaczenie badań nad medycyną precyzyjną w celu identyfikacji biomarkerów do stratyfikacji leczenia i opracowania algorytmów prognostycznych zostało podkreślone przez dwa niedawne krajowe ćwiczenia priorytetyzacji badań, uwzględniające odpowiedzi od prawie 3000 pacjentów, ich rodzin i przyjaciół1. Zwalidowane modele prognostyczne do stratyfikacji leczenia nie istnieją, a zrozumienie mechanizmów kontrolujących brak odpowiedzi na leczenie jest ograniczone1.

IBD-RESPONSE dostarczy aktualnych i ważnych informacji dotyczących związków między mikrobiomem jelitowym a odpowiedzią na leczenie w IBD. Prawdopodobnie podkreśli potencjalne mechanizmy, poprzez które mikrobiota może napędzać zapalenie1. Badacze mają nadzieję, że wyniki IBD-RESPONSE doprowadzą do nowych spersonalizowanych dróg leczenia IBD poprzez odkrycie i walidację narzędzi predykcyjnych, które mogą być bezpośrednio włączone do praktyki klinicznej lub dalej testowane w stratyfikowanych badaniach klinicznych1.

Ryzyko powikłań i raka

IBD jest często związane ze zwiększonym ryzykiem rozwoju raka jelita grubego (CRC)1. Pomimo że IBD-związany CRC stanowi 2% wszystkich przypadków CRC, jest główną przyczyną śmierci u pacjentów z IBD, stanowiąc 10-15% wszystkich przyczyn śmiertelności1. Szacuje się, że dla każdej dekady, w której pacjent zdiagnozowany z IBD żyje, istnieje przyrostowe zwiększone ryzyko rozwoju CRC: 2,9% po 10 latach, 5,6% po 20 latach i 8,3% po 30 latach1.

Sekwencja zapalenie-dysplazja-rak IBD-CRC różni się od klasycznej sekwencji gruczolak-gruczolakorak i wiąże się z gorszym rokowaniem1. To w konsekwencji podkreśla potrzebę opracowania dokładnych środków przewidywania trajektorii choroby w celu złagodzenia niekorzystnych wyników1.

Chociaż istniejące biomarkery okazały się przydatne w różnicowaniu IBD od czynnościowej choroby jelit, monitorowaniu progresji choroby, przewidywaniu nawrotów i skuteczności terapeutycznej, a także w rokowaniu klinicznym, czułość i swoistość tych markerów są pod wpływem innych współistniejących modalności chorobowych. Tymczasem konwencjonalne metody diagnostyczne są często inwazyjne, mają ograniczoną czułość i nie są zgodne z aktywnością choroby, co podkreśla kluczową potrzebę identyfikacji alternatywnych biomarkerów, które mogą być przydatne do wczesnej diagnozy1.

Podsumowanie i perspektywy na przyszłość

Prognostyka w chorobach zapalnych jelit opiera się na analizie heterogeniczności pacjentów z IBD poprzez prognozowanie przebiegu ich choroby i odpowiedzi terapeutycznej, aby umożliwić dostosowane strategie leczenia i monitorowania w celu optymalizacji opieki1. Udana prognostyka w IBD będzie obejmować przewidywanie (1) przebiegu choroby pacjenta, (2) odpowiedzi na leczenie oraz (3) ryzyka działań niepożądanych lub toksyczności związanych z terapią1.

Przyszłe podejścia precyzyjne powinny mieć na celu proaktywne zwiększanie immunosupresji na podstawie biomarkerów przedklinicznych, aby zapobiec agresywnemu przebiegowi choroby w przyszłości1. Istotą medycyny precyzyjnej jest właściwe podejście we właściwym momencie dla każdego indywidualnego pacjenta1.

Choć obecnie dostępne są możliwe do zastosowania narzędzia do prognozowania w IBD, pozostaje to przestrzeń gotowa na wspólne wysiłki badawcze w celu zapewnienia spersonalizowanej opieki przy użyciu bogatych danych multi-omicznych w celu poprawy wyników u pacjentów z IBD1.

Kolejne rozdziały

Zapraszamy do dalszego czytania naszego leksykonu.

Wybierz kolejny rozdział z menu poniżej, aby otworzyć nową podstronę kompedium wiedzy i uzyskać szczegółowe informację o leku, substancji lub chorobie.

  1. 12.04.2026
  2. www.leksykon.com.pl

Materiały źródłowe

  • #1 Improving prediction of disease outcome for inflammatory bowel disease: progress through systems medicine
    https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8903817/
    Inflammatory bowel diseases (IBDs) are lifelong conditions causing relapsing inflammation of the intestine. In the absence of a cure, clinical management of IBDs is extremely challenging since they present with a wide range of phenotypes and disease behaviors. Hence, there is an urgent need for markers that could guide physicians in making the right choice of the rapidly growing treatment options toward a personalized care that could improve the overall outcome. […] The development of disease prognostic biomarkers is even more complicated by the absence of a widely accepted and/or validated disease outcome score, particularly since defining disease outcome in IBD is far from trivial given the wide range of organic and non-organic factors contributing to patient health and wellbeing. […] Taken together, in order to make real progress in the development of disease prognostic and/or predictive biomarkers in IBD, both disease heterogeneity and complexities of large omics datasets must be addressed in structured and unbiased way. Systems medicine offers a sophisticated approach to investigate not only complex molecular and cellular interactions but also allows for a holistic, systematic, and unbiased analysis of integrated high-throughput omics with clinical datasets.
  • #1 Applying Precision Medicine to IBD
    https://consultqd.clevelandclinic.org/adopting-a-precision-medicine-approach-to-outcome-prediction-in-inflammatory-bowel-disease
    Inflammatory bowel disease (IBD) was once generally considered a dichotomous disease group. Patients either suffered from Crohns disease (CD) or ulcerative colitis (UC) and were treated accordingly. […] Genetic discoveries have challenged this traditional view, with an emerging understanding of IBD as a heterogenous condition with a range of subphenotypes with varying levels of severity and responses to treatment types. […] To reflect the reality of the diseases we treat, we must move more rapidly and systematically toward a precision medicine approach. […] If we could identify biomarkers that reliably predict which patients will have a disease course that necessitates pharmacological intervention and then which patients will respond to a particular medication, we can save a lot of morbidity and mortality.
  • #1 Improving prediction of disease outcome for inflammatory bowel disease: progress through systems medicine
    https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8903817/
    Taken together, there is currently no convincing evidence for clinical parameters at the point of diagnosis to predict future disease outcome in CD patients. […] The development of molecular markers capable of predicting outcome or response to treatment in patients with IBD is far from trivial for a number of reasons. […] Considering the expected diversity of IBD and assuming that a valid disease prognostic biomarker is relevant to disease pathogenesis, as variations could therefore explain differences in disease behavior, it seems unlikely that a single marker could be applied to all patients. […] The development of disease prognostic biomarkers in IBD has been hampered by the lack of existing, quantifiable, validated outcome measures. […] Disease prognosis does not predict response to a specific therapy in IBD.
  • #1 Applying Precision Medicine to IBD
    https://consultqd.clevelandclinic.org/adopting-a-precision-medicine-approach-to-outcome-prediction-in-inflammatory-bowel-disease
    Short-term treatment response is a meaningful endpoint, but research has shown that it does not correlate with rates of future tissue damage and remodeling. […] Validated predictive biomarkers to define future disease course are lacking in essentially all major areas of IBD. […] Future precision approaches should aim to proactively escalate immune suppression on the basis of preclinical biomarkers to prevent an otherwise aggressive future disease course. […] Traditional prediction studies dont account for our advancing understanding of IBD pathogenesis, which necessitates a systems biology approach that allows us to integrate analyses of individual -omes into a whole result that is greater than the sum of its parts. […] The end goal? A validated mucosal biomarker that can inform treatment decisions and define clinical trial populations. The bottom line in precision medicine is the right approach at the right moment for each individual patient.
  • #1 Frontiers | Prognostication in inflammatory bowel disease
    https://www.frontiersin.org/journals/medicine/articles/10.3389/fmed.2022.1025375/full
    Prognostication in inflammatory bowel disease (IBD) hinges on parsing the heterogeneity of IBD patients through prognostication of their disease course and therapeutic response to allow for tailor-made treatment and monitoring strategies to optimize care. […] Successful prognostication in IBD will encompass prediction of a patient’s (1) disease course, (2) treatment response, and (3) risk of adverse effects or toxicities from therapy. […] In current clinical practice, most prognostication is rooted in clinical variables supplemented with traditional laboratory monitoring, like C-reactive protein (CRP) and fecal calprotectin (FC). […] Clinical factors have been identified in numerous retrospective analyses of both Crohn’s disease (CD) and ulcerative colitis (UC) to predict disease course.
  • #1 Frontiers | Prognostication in inflammatory bowel disease
    https://www.frontiersin.org/journals/medicine/articles/10.3389/fmed.2022.1025375/full
    An elevated CRP at diagnosis has been associated with a later need for surgery in both CD and UC. […] Serial measurements have been shown to predict disease progression and/or relapse. […] There is much on the horizon with significant research, increasingly with an eye toward global, collaborative efforts, being performed in the space of prognostication. […] While there are currently feasible tools available to prognosticate in IBD, it remains a space ripe for collaborative research efforts to deliver personalized care using rich multi-omic data to improve outcomes in patients with IBD.
  • #1 A comparison of diagnostic performance between two quantitative rapid fecal calprotectin assays in detecting active inflammatory bowel disease | PLOS One
    https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0255974
    Fecal calprotectin (FC) is widely used for the diagnosis and monitoring disease activity of inflammatory bowel disease (IBD). […] The clinical value of fecal calprotectin assays in the diagnosis and assessment of endoscopic disease activities of IBD has been proven. […] The results of the two rapid FC assays iChroma and Buhlmann showed a significant correlation, but the two test results were not interchangeable. […] With optimized cut-off values, rapid FC tests could be helpful in the diagnosis of IBD and differentiating active IBD from inactive or organic bowel disease. […] The diagnostic performance including sensitivity and specificity for detecting active IBD for the two FC assays were calculated. […] The performance in both cases was very low, 70%, when considering the recommended fixed specificity of 80% to 95%.
  • #1 Predicting Treatment Response in Inflammatory Bowel Diseases: Cross-Sectional Imaging Markers
    https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10532020/
    Therapeutic options for inflammatory bowel diseases (IBD) have largely expanded in the last decades, both in Crohn’s disease and ulcerative colitis, including multiple biological drugs targeting different inflammation pathways. […] Therefore, early prediction of the response to biological drugs becomes of utmost importance, allowing prompt optimization of therapeutic strategies and thus paving the way towards precision medicine. […] Predicting the response to biologic drugs, therefore, would be of utmost importance to directly choose the most appropriate therapy for the single patient, helping to further improve clinical care and cost-effectiveness. […] Many predictive markers have been examined among clinical, serologic, genetic, endoscopic, and radiologic factors. […] Cross-sectional imaging, including intestinal ultrasound (IUS), magnetic resonance imaging (MRI), and more specifically magnetic resonance enterography (MRE) and computed tomography enterography (CTE), are essential tools for disease activity monitoring and early detection of signs of response or failure to biological therapies.
  • #1 Predicting Treatment Response in Inflammatory Bowel Diseases: Cross-Sectional Imaging Markers
    https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10532020/
    Based on such considerations, research has begun to investigate the utility of cross-sectional imaging not only in monitoring but also in predicting pharmacological treatment response. […] In this review, we summarize the most up-to-date evidence about cross-imaging features having a role in predicting treatment response or failure. […] IUS has a great accuracy in detecting TH, showing a high agreement with MRE and mucosal healing. […] A recent systemic review and expert consensus evaluated treatment response based on IUS parameters. […] In a large, prospective observational study, Allocca et al. performed IUS on a cohort of 225 CD patients to investigate the role of IUS in predicting a 12-month disease course. […] Interestingly, in the last few years, researchers’ attention has focused on IUS’s ability to determine an early response to treatment.
  • #1 Predicting Treatment Response in Inflammatory Bowel Diseases: Cross-Sectional Imaging Markers
    https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10532020/
    The predictive role of SICUS has been examined in an observational study by Zorzi et al., who enrolled 80 CD patients treated with anti-TNF drugs who underwent SICUS before and 18 months after treatment induction. […] Compared with CD, the role of IUS in UC is still less defined. […] However, data about IUS features predictive of therapeutic response or non-response is still scarce. […] The accuracy of IUS in assessing UC disease activity has recently been demonstrated. […] As far as we know, no data about CEUS’s role in the early prediction of treatment response in UC is available. […] However, the need for contrast media and specific training still restricts the widespread use of D-CEUS and SICUS. […] In such a context, as underlined in the recent review by Alfarone et al., new MRE-based techniques may be promising, notably magnetization transfer (MT) and motility MRI (mMRI).
  • #1 Predicting Treatment Response in Inflammatory Bowel Diseases: Cross-Sectional Imaging Markers
    https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10532020/
    The main MRE and DWI features reflecting active disease and predicting therapeutic response are shown in Figure 4. […] The predictive role of CTE in predicting disease activity is lacking. […] However, promising perspectives come from advanced technologies, namely radiomics. […] In a pilot study, our group first demonstrated the role of radiomics in predicting the risk of surgery at ten years in a cohort of CD patients. […] On the other hand, to the best of our knowledge, only two studies exist on the role of radiomics in predicting treatment response. […] The main cross-sectional imaging predictors of treatment response in IBD are summarized in Table 2. […] In such a context, both IUS and MRE appear particularly promising, and different parameters have been identified as potential predictive markers. […] However, data on possible predictive markers is recent and needs to be implemented and validated. […] Further studies are required to make cross-sectional imaging a reliable guide for IBD physicians aiming to identify the best therapeutic algorithm.
  • #1 Improving prediction of disease outcome for inflammatory bowel disease: progress through systems medicine
    https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8903817/
    Systems biology provides an unbiased approach towards addressing variation in both omics and clinical datasets and has been successfully employed for the development of prognostic biomarkers in other diseases. […] The development of disease predictive biomarkers may provide a more realistic and equally beneficial alternative.
  • #1
    https://link.springer.com/article/10.1007/s10528-024-10917-z
    To address this caveat, we focussed on transcription factor (TF)-based markers as they accurately represent the dynamic regulatory mechanisms that control disease-related gene expression and are more sensitive and informative for tracking disease development, therapy effectiveness and personalized medicine approaches by collecting real-time information about a cell’s reaction to changing conditions, as opposed to static gene markers. […] Therefore, the change in expression level of one TF will affect the network of hundreds of genes linked with a disease. […] An in-silico approach was used to confirm the role of selected TFs in the development of the IBD and its progression through mining of biological databases such as ONCOMINE, TCGA and Gene Expression Atlas. […] The combination of RUNX1 with four additional biomarkers, namely, SPIB, ELF5, SPI1 and FEV, enhanced diagnostic accuracy exhibiting a sensitivity of 99% and specificity of 95%.
  • #1
    https://link.springer.com/article/10.1007/s10528-024-10917-z
    Consequently, factoring in the limitations of each of these biomarkers individually, it can be stated that none of these markers may be used in isolation to accurately predict IBD to CRC progression and our study posits that the combination of these biomarkers has the potential to greatly improve the diagnostic accuracy.
  • #1 Defining predictors of responsiveness to advanced therapies in Crohn’s disease and ulcerative colitis: protocol for the IBD-RESPONSE and nested CD-metaRESPONSE prospective, multicentre, observational cohort study in precision medicine | BMJ Open
    https://bmjopen.bmj.com/content/14/4/e073639
    Inflammatory bowel disease (IBD) symptoms including diarrhoea, abdominal pain and fatigue can significantly impact patients quality of life. […] A significant challenge is an inability to predict which treatment will benefit individual patients. […] IBD-RESPONSE will use multi-omic data to create a predictive tool for treatment response. Future patient benefit may include development of biomarker-based treatment stratification or manipulation of intestinal microbial targets. […] This prospective, multicentre, observational study will identify and validate a predictive model for response to advanced IBD therapies, incorporating gut microbiome, metabolome, single-cell transcriptome, human genome, dietary and clinical data. […] The primary scientific objective of IBD-RESPONSE is to identify and validate a predictive model for clinical response or failure to respond to advanced therapies in IBD after 14 weeks of therapy.
  • #1 Defining predictors of responsiveness to advanced therapies in Crohn’s disease and ulcerative colitis: protocol for the IBD-RESPONSE and nested CD-metaRESPONSE prospective, multicentre, observational cohort study in precision medicine | BMJ Open
    https://bmjopen.bmj.com/content/14/4/e073639
    The absolute importance of precision medicine research to identify biomarkers for treatment stratification and develop prognostic algorithms was highlighted by two recent national research prioritisation exercises incorporating responses from almost 3000 patients, their families and friends. […] Validated prognostic models for treatment stratification do not exist and understanding of mechanisms controlling treatment non-response is limited. […] IBD-RESPONSE will provide timely and important information regarding associations between the gut microbiome and responsiveness to treatment in IBD. It will likely highlight potential mechanisms through which the microbiota may drive inflammation. […] We hope that findings from IBD-RESPONSE will lead to new personalised avenues for IBD treatment through discovery and validation of predictive tools that may be incorporated directly into clinical practice or further tested in stratified clinical trials.
  • #1
    https://link.springer.com/article/10.1007/s10528-024-10917-z
    Inflammatory bowel disease (IBD) has become a common global health problem as prevalence continues to rise. It is often associated with increased risk of colorectal cancer (CRC) development. […] Therefore, these preliminary results once validated in large patient cohorts could potentially have a significant impact on CRC disease stratification, resulting in a more precise prediction for treatment and treatment outcomes, especially in South African patients. […] Even though IBD-associated CRC accounts for 2% of all CRC cases, it constitutes a major cause of death in IBD patients, amounting to 10-15% of all-cause mortality. […] It is estimated that for every decade that a patient diagnosed with IBD lives, there is an incremental increased risk of developing CRC, 2.9% after 10 years, 5.6% after 20 years and 8.3% after 30 years.
  • #1
    https://link.springer.com/article/10.1007/s10528-024-10917-z
    From the above, it is evident that the inflammation-dysplasia-carcinoma sequence of IBD-CRC is distinct from the classical adenoma-adenocarcinoma sequence and confers a poorer prognosis. […] This consequently highlights the incipient need to develop accurate means of predicting disease trajectory to mitigate adverse outcomes. […] Although existing biomarkers have proven useful in differentiating IBD from functional bowel disease, monitoring disease progression, the prediction of recurrence and therapeutic efficacy, as well as clinical prognosis, yet the sensitivity and specificity of these markers are influenced by other co-existing disease modalities, whereas conventional diagnostic methods are often invasive with limited sensitivity and incongruent with disease activity, highlighting the crucial need to identify alternative biomarkers that may be useful for early diagnosis.