pseudoekson
Pseudoekson to fragment sekwencji DNA przypominający ekson, ale niefunkcjonalny w kontekście transkrypcji i translacji. W przeciwieństwie do prawdziwych eksonów, które są fragmentami genów kodującymi białka, pseudoeksony nie są włączane do dojrzałego mRNA podczas procesu splicingu, mimo że posiadają sekwencje rozpoznawcze dla maszynerii splicingowej.
Pseudoeksony mogą powstać w wyniku mutacji w sekwencji DNA, które tworzą miejsca splicingowe przypominające te w funkcjonalnych eksonach. Niektóre z nich są fragmentami pseudogenów lub zdegenerowanych genów, które utraciły swoją funkcję w toku ewolucji. Ich obecność ma znaczenie w diagnostyce molekularnej, gdyż mutacje aktywujące pseudoeksony mogą prowadzić do włączenia ich do dojrzałego mRNA, co skutkuje zaburzeniami funkcji białek i może być przyczyną chorób genetycznych.
W badaniach genetycznych identyfikacja pseudoeksonów jest istotna przy analizie transkryptomu oraz przy projektowaniu testów diagnostycznych opartych na sekwencjonowaniu DNA. Metody bioinformatyczne umożliwiają przewidywanie pseudoeksonów na podstawie charakterystycznych cech sekwencji, co ma zastosowanie w medycynie personalizowanej i terapiach genowych.
Powiązane wpisy
- Leksykon chorób i schorzeń
Zespół niewrażliwości na androgeny – Patofizjologia i mechanizm
Zespół niewrażliwości na androgeny (AIS) jest spowodowany mutacjami w genie receptora androgenowego (AR) na chromosomie Xq11-12, prowadzącymi do dysfunkcji receptora i oporności na androgeny. Mutacje obejmują ponad 1000 wariantów, głównie missense w domenie wiążącej ligand, ale także splicingowe, nonsensowne, insercje, delecje i mutacje w regionach niekodujących. AIS manifestuje się spektrum fenotypów od całkowitej feminizacji (CAIS) do łagodnych zaburzeń męskich cech płciowych (MAIS). Receptor androgenowy, białko o długości około 920 aminokwasów, zawiera domeny N-terminalną, wiążącą DNA oraz wiążącą ligand (LBD), a mutacje mogą zaburzać wiązanie liganda, translokację jądrową, dimeryzację i regulację transkrypcji. Diagnostyka opiera się na fenotypie, kariotypie 46,XY, badaniach hormonalnych (podwyższone LH i testosteron, prawidłowe 17-OH-progesteron, DHEA, androstendion, estradiol) oraz potwierdzeniu mutacji AR w badaniach molekularnych.
całkowity zespół niewrażliwości na androgeny, częściowy zespół niewrażliwości na androgeny, dihydrotestosteron, domena wiążąca DNA, fibroblast skóry, gen receptora androgenowego, gęstość mineralna kości, globulina wiążąca hormony płciowe, gonadotropina kosmówkowa, hormon anty-Müllerowski, hormon luteinizujący, hormon steroidowy, łagodny zespół niewrażliwości na androgeny, mozaicyzm somatyczny, mutacja missense, mutacja nonsensowna, mutacja somatyczna, mutacja splicingowa, powinowactwo wiązania, przesunięcie ramki odczytu, przewód Müllera, przewód Wolffa, przypisanie płci, pseudoekson, technologia wspomaganego rozrodu, translokacja jądrowa, zespół niewrażliwości na androgeny - Leksykon chorób i schorzeń
Zespół niewrażliwości na androgeny – Etiologia i przyczyny
Zespół niewrażliwości na androgeny (AIS) jest spowodowany mutacjami w genie receptora androgenowego (AR) na chromosomie Xq11-12, prowadzącymi do dysfunkcji receptorów androgenowych mimo prawidłowych poziomów androgenów. Mutacje obejmują delecje, insercje, mutacje punktowe oraz zmiany splicingu, w tym głębokie mutacje intronowe aktywujące pseudoeksony, co skutkuje nieprawidłowym splicingiem mRNA i brakiem funkcjonalnego białka AR. Dziedziczenie jest recesywne sprzężone z chromosomem X, a około 30% mutacji to mutacje de novo. Fenotyp AIS jest heterogenny i obejmuje trzy główne formy: całkowity AIS (CAIS) z fenotypem żeńskim u 46,XY, częściowy AIS (PAIS) z niejednoznacznymi narządami płciowymi oraz łagodny AIS (MAIS) z prawidłowym fenotypem męskim. Występuje brak ścisłej korelacji genotyp-fenotyp, co sugeruje udział koregulatorów AR, aktywności 5-alfa-reduktazy typu 2 oraz mozaicyzmu somatycznego. Diagnostyka molekularna powinna obejmować sekwencjonowanie całego genu AR, w tym regionów intronowych, zwłaszcza u noworodków 46,XY z DSD.
całkowity zespół niewrażliwości na androgeny, częściowy zespół niewrażliwości na androgeny, dihydrotestosteron, dysfunkcja komórek Leydiga, dziedziczenie recesywne sprzężone z chromosomem X, gen SRY, gonadektomia, hormon androgenowy, łagodny zespół niewrażliwości na androgeny, metylacja DNA, mieszana dysgenezja gonad, mozaicyzm somatyczny, mutacja de novo, mutacja genu receptora androgenowego, nowotwór komórek rozrodczych, pseudoekson, receptor androgenowy, splicing mRNA, wirylizacja, wnętrostwo, zaburzenie rozwoju płciowego, zespół niewrażliwości na androgeny