LAMP
LAMP (Loop-mediated isothermal amplification) to technika molekularna służąca do amplifikacji kwasów nukleinowych, opracowana jako alternatywa dla klasycznej reakcji PCR. Metoda charakteryzuje się wysoką specyficznością, wydajnością i zdolnością do prowadzenia reakcji w warunkach izotermicznych (stała temperatura, zazwyczaj 60-65°C), co eliminuje potrzebę stosowania zaawansowanych termocyklerów.
Technika LAMP wykorzystuje 4-6 specjalnie zaprojektowanych primerów oraz polimerazę Bst o aktywności wypierania nici, co umożliwia tworzenie struktur pętlowych DNA i szybką amplifikację materiału genetycznego. Zaletą metody jest możliwość wykrywania produktu reakcji przy użyciu prostych metod wizualnych (zmiana barwy, fluorescencja), bez konieczności stosowania elektroforezy.
W medycynie diagnostycznej LAMP znajduje zastosowanie w szybkiej identyfikacji patogenów (wirusów, bakterii, pasożytów), w tym SARS-CoV-2, prątków gruźlicy, malarii czy wirusa Zika. Metoda ta jest szczególnie przydatna w diagnostyce typu point-of-care oraz w ośrodkach o ograniczonych zasobach ze względu na niskie wymagania sprzętowe, krótki czas analizy (30-60 minut) i wysoką czułość zbliżoną do klasycznego PCR.
Powiązane wpisy
- Leksykon chorób i schorzeń
Pałeczka okrężnicy – Diagnostyka i diagnoza
Escherichia coli, Gram-ujemna pałeczka jelitowa, obejmuje zarówno szczepy komensalne, jak i patogenne, które mogą wywoływać schorzenia od łagodnych biegunek po zagrażające życiu zespoły hemolityczno-mocznicowe (HUS). Diagnostyka laboratoryjna opiera się na badaniu próbek klinicznych (kał, mocz, krew, płyn mózgowo-rdzeniowy) z zastosowaniem metod hodowlanych (np. posiew na agarze sorbitolowym MacConkeya – SMAC, CT-SMAC), testów immunoenzymatycznych (EIA) wykrywających toksynę Shiga, PCR na geny stx1 i stx2 oraz nowoczesnych technik molekularnych, takich jak multiplex PCR, LAMP, MALDI-TOF i sekwencjonowanie całogenomowe (WGS). Szczególną uwagę zwraca się na wykrywanie szczepu E. coli O157:H7, który tworzy bezbarwne kolonie na SMAC, oraz innych szczepów STEC, ze względu na ryzyko HUS, zwłaszcza u dzieci poniżej 5 lat i osób starszych. W diagnostyce zakażeń układu moczowego (ZUM), gdzie E. coli odpowiada za 75-90% przypadków, kluczowe jest badanie ogólne moczu, posiew z oceną znamiennej bakteriurii (≥10^5 CFU/ml) oraz antybiogram, szczególnie w kontekście potencjalnej produkcji beta-laktamaz o rozszerzonym spektrum (ESBL), identyfikowanej na podstawie stref zahamowania wzrostu ≤22 mm dla ceftazydymu (30 μg), ≤25 mm dla ceftriaksonu (30 μg) i ≤27 mm dla cefotaksymu (30 μg).
agar MacConkeya, antybiogram, antybiotykoterapia, badanie kału, badanie ogólne moczu, bakteriemia, bakteriuria, EAEC, ESBL, Escherichia coli, ETEC, LAMP, MALDI-TOF, małopłytkowość, multiplex PCR, niedokrwistość hemolityczna, niedrożność jelit, nieswoiste zapalenie jelit, ostre uszkodzenie nerek, PCR, płyn mózgowo-rdzeniowy, posiew krwi, posiew moczu, sekwencjonowanie genomu, STEC, test immunoenzymatyczny, toksyna shiga, wirusowe zapalenie żołądka, zakażenie układu moczowego, zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych, zapalenie uchyłków, zapalenie wyrostka robaczkowego, zespół hemolityczno-mocznicowy - Leksykon chorób i schorzeń
Schistosomatoza (bilharcjoza) – Diagnostyka i diagnoza
Schistosomiasis to choroba pasożytnicza wywoływana przez przywry z rodzaju Schistosoma, diagnozowana głównie poprzez badanie mikroskopowe kału i/lub moczu w celu wykrycia jaj pasożyta. W przypadku S. haematobium badanie moczu (pobierane najlepiej między 10:00 a 14:00, ostatnie 10-20 ml) jest preferowane, natomiast dla S. mansoni, S. japonicum, S. mekongi i S. intercalatum stosuje się badanie kału, najczęściej techniką Kato-Katz, umożliwiającą ocenę intensywności infekcji (liczba jaj na gram kału – EPG). Diagnostyka parazytologiczna cechuje się wysoką specyficznością, ale ograniczoną czułością, zwłaszcza przy niskim obciążeniu pasożytniczym i w początkowych fazach zakażenia (jaja pojawiają się po 6-8 tygodniach). W diagnostyce uzupełniającej stosuje się testy serologiczne (ELISA, FMI, IB, FAST ELISA, IHA) oraz testy antygenowe wykrywające krążące antygeny (CAA i CCA), które odzwierciedlają aktywną infekcję i szybko reagują na leczenie (np. spadek CCA w moczu już następnego dnia po terapii). Metody molekularne, takie jak real-time PCR, LAMP, RPA i techniki oparte na CRISPR, oferują wysoką czułość i specyficzność, umożliwiając wykrycie DNA pasożyta nawet przy niskim obciążeniu, jednak ich stosowanie jest ograniczone przez koszty i wymagania sprzętowe.
badanie parazytologiczne, badanie serologiczne, biopsja błony śluzowej, biopsja tkanki, immunoblot, LAMP, neuroschistosomiasis, ostra schistosomiasis, PCR, przywra Schistosoma, real-time PCR, RPA, Schistosoma haematobium, Schistosoma mansoni, schistosomiasis, schistosomiasis jelitowa, schistosomiasis moczowo-płciowa, serokonwersja, technika Kato-Katz, technika molekularna, test ELISA, włóknienie okołowrotne, zespół Katayama - Leksykon chorób i schorzeń
Choroba wirusowa ebola – Diagnostyka i diagnoza
Choroba wirusowa Ebola (EVD) charakteryzuje się wysoką śmiertelnością (>50%) i wymaga wczesnej, precyzyjnej diagnostyki, która jest utrudniona przez niespecyficzne objawy początkowe oraz ograniczony dostęp do laboratoriów w regionach endemicznych. Diagnostyka opiera się głównie na testach molekularnych RT-PCR, uznawanych za złoty standard, wykrywających RNA wirusa w próbkach krwi (pobranych do probówek z EDTA). W przypadku negatywnego wyniku u pacjentów z objawami lub kontaktem z zakażonymi, zaleca się powtórzenie testu po 72 godzinach. Testy serologiczne (ELISA IgM i IgG) są użyteczne w późniejszych fazach choroby, natomiast szybkie testy diagnostyczne (RDT) nie osiągają wymaganej przez WHO czułości 99%, dlatego negatywne wyniki RDT muszą być potwierdzone testami molekularnymi. Diagnostyka różnicowa obejmuje m.in. malarię, dur brzuszny, wirusy gorączek krwotocznych oraz infekcje bakteryjne, co jest kluczowe dla właściwego leczenia i postępowania.
Borrelia, choroba wirusowa ebola, Coxiella burnetii, dur brzuszny, ebolawirus, ELISA, izolacja wirusa, LAMP, malaria, metoda immunochromatograficzna, riketsjozy, rozsiane wykrzepianie wewnątrznaczyniowe, RPA, RT-PCR, szybki test diagnostyczny, test immunohistochemiczny, wirus Lassa, wirus żółtej gorączki, wirusowa gorączka krwotoczna