Szybki test przepływowy na covid-19 – Rokowania, prognozy i postęp choroby

Szybki test przepływowy na covid-19
Rokowania, prognozy i postęp choroby

Szybkie testy przepływowe (LFTs) stanowią istotne narzędzie diagnostyczne w wykrywaniu zakażeń SARS-CoV-2, szczególnie w pierwszym tygodniu od pojawienia się objawów, kiedy czułość testów osiąga średnio 82%. W populacji objawowej czułość wynosi około 73%, a w bezobjawowej 55%, przy wysokiej swoistości sięgającej 99,91%. Testy te są szczególnie użyteczne w okresach wysokiej prewalencji, gdy miano wirusa jest wysokie, umożliwiając szybkie wykrycie zakażenia i wczesne wdrożenie leczenia. Nowe generacje testów antygenowych wykazują czułość do 92,86% wobec wariantu Omikron, co potwierdza ich skuteczność w wykrywaniu nowych podwariantów SARS-CoV-2. Mimo to, testy LFT mają ograniczenia, zwłaszcza w wykrywaniu zakażeń o niskim mianie wirusa, co podkreśla konieczność potwierdzania wyników pozytywnych testem RT-PCR oraz powtarzania testów u osób z negatywnym wynikiem, które nadal wykazują objawy.

Wprowadzenie do szybkich testów przepływowych na COVID-19

Szybkie testy przepływowe (lateral flow tests, LFTs) to metoda diagnostyczna wykorzystywana do wykrywania zakażenia SARS-CoV-2, która znalazła szerokie zastosowanie w czasie pandemii COVID-19. Testy te są stosowane do badań przesiewowych od początku 2021 roku w wielu krajach, w tym w Walii i Wielkiej Brytanii.¹ LFTs można wykonać samodzielnie, co umożliwia szybkie wykrycie obecności wirusa bez konieczności wizyt w placówkach medycznych.²³ Jest to szczególnie istotne dla osób z grup wysokiego ryzyka ciężkiego przebiegu COVID-19, które mogą kwalifikować się do wczesnego leczenia.²

Szybkie testy przepływowe (LFTs) weszły do powszechnego użytku jako jedno z najwygodniejszych i szeroko stosowanych narzędzi do wykrywania patogenów zarówno w warunkach szpitalnych, jak i domowych. Dzięki niskim kosztom, prostocie wykonania i szybkości uzyskiwania wyników, metoda ta znacząco przyczyniła się do kontroli transmisji wirusa SARS-CoV-2.⁴⁵

Dokładność i wiarygodność testów przepływowych

Dokładność szybkich testów przepływowych w diagnozowaniu COVID-19 różni się w zależności od czynników takich jak obecność objawów, czas od początku zakażenia i poziom wiremii. Badania wykazują, że czułość testów LFT jest wyższa u osób z objawami COVID-19, szczególnie w pierwszym tygodniu choroby, kiedy miano wirusa jest najwyższe.⁶⁷

Testy wykazują znacznie wyższą skuteczność w wykrywaniu zakażenia u pacjentów z objawami (średnio 73% prawidłowo zidentyfikowanych przypadków) w porównaniu do osób bezobjawowych (średnio 55%).⁶ Najwyższą dokładność obserwuje się w pierwszym tygodniu od wystąpienia objawów, kiedy to testy wykrywają średnio 82% potwierdzonych przypadków.⁶

W jednym z badań przeprowadzonych w Walii na pracownikach domów opieki, zgodność wyników testów LFT z testami PCR wyniosła 99,59% (95% CI 99,55-99,63). Czułość testów szacowano na 25,65% (95% CI 22,02-29,67), natomiast swoistość wyniosła 99,91% (95% CI 99,89-99,93).¹ Wysoka swoistość i wartość predykcyjna ujemna w badanej populacji bezobjawowej wskazuje, że testy te są skutecznym narzędziem do identyfikacji przypadków zakażenia SARS-CoV-2 w okresach wysokiej prewalencji, kiedy transmisja jest bardziej prawdopodobna ze względu na wysokie miano wirusa.¹

Skuteczność wykrywania wariantów Omikron

W kontekście nowszych wariantów wirusa SARS-CoV-2, szczególnie wariantu Omikron, zaobserwowano pogorszenie skuteczności wielu dostępnych na rynku szybkich testów antygenowych (RATs). Wyniki badań sugerują niższą czułość testów w przypadku wariantu Omikron, zwłaszcza przy wyższych wartościach cyklu progowego (Ct) powyżej 25 oraz u osób bezobjawowych.⁸

Jednakże opracowano również nowe generacje testów RAT, które wykazują wysoką czułość nawet wobec wariantu Omikron. W badaniach niektóre z tych nowych testów osiągały czułość do 92,86% (95% CI 82,71%-98,02%) w porównaniu do testów RT-PCR, 94,23% (95% CI 83,07%-98,49%) w porównaniu do testów RT-PCR specyficznych dla Omikronu oraz 97,95% (95% CI 87,76%-99,89%) w porównaniu do sekwencjonowania genomu.⁸ Wyniki te wskazują, że nowe generacje testów SARS-CoV-2 Rapid Antigen Test 2.0 oraz SARS-CoV-2 Rapid Antigen Test 2.0 Nasal są użytecznymi i efektywnymi narzędziami w wykrywaniu SARS-CoV-2, szczególnie podczas fali podwariantów Omikronu.⁹

Porównanie z testami RT-PCR

Badania porównujące skuteczność szybkich testów przepływowych z laboratoryjnymi testami PCR wykazały, że przy prawidłowym zastosowaniu, LFTs mogą wykrywać COVID-19 z podobną dokładnością jak testy PCR, pod warunkiem że są stosowane na początku infekcji i wkrótce po wystąpieniu objawów.¹⁰

W badaniu przeprowadzonym przez naukowców z Queen Mary University of London, University of Oxford, Institute for Advanced Studies w Wiedniu oraz Medical University of Graz wykazano, że testy przepływowe wykryły ponad 95% przypadków zidentyfikowanych przez PCR oraz prawidłowo zidentyfikowały 89% przypadków jako negatywne.¹⁰ Badacze podkreślają, że zarówno krótszy czas trwania objawów, jak i wyższe miano wirusa były istotnie związane z pozytywnymi wynikami testów przepływowych, co wskazuje na konieczność wykonywania testów we wczesnej fazie infekcji.¹¹

Wyniki te dostarczają dowodów, że testy przepływowe mogą dokładnie wykrywać zakażenie SARS-CoV-2 jako alternatywa dla testów PCR wśród pacjentów z objawami w rzeczywistych warunkach podstawowej opieki zdrowotnej na dużym obszarze geograficznym.¹¹

Ograniczenia testów przepływowych

Pomimo wielu zalet, szybkie testy przepływowe mają swoje ograniczenia. Analiza przewidywań dokonanych przez wpływowe modele matematyczne w porównaniu z empirycznymi badaniami wykazała, że modele te znacznie przeszacowały czułość testów LFT.¹²

Odsetek osób zakaźnych z SARS-CoV-2, których nie wykryły testy LFT, jest na tyle znaczący, aby miał znaczenie kliniczne. Analiza przewidywała, że test Innova nie wykryje 20% osób odwiedzających centrum NHS Test-and-Trace, 29% osób bez objawów uczestniczących w masowych testach miejskich oraz 81% osób bez objawów uczestniczących w badaniach przesiewowych na uniwersytetach, a także odpowiednio 38%, 47% i 90% źródeł wtórnych przypadków.¹²

Królewskie Kolegium Patologów (RCPath) uznaje potencjalną rolę testów antygenowych lateral flow dla COVID-19 (LFTAg), gdy są one używane w sposób kontrolowany i ukierunkowany jako część ogólnej strategii testowania. Jednakże przypomina się społeczeństwu, że obecnie stosowane wersje tych testów nie mają wystarczającej czułości lub dokładności, aby wykluczyć możliwość, że wynik negatywny może nie być prawidłowy.¹³

W miarę spadku częstości występowania infekcji w populacji, dodatnia wartość predykcyjna testu również spada, co oznacza, że proporcja wyników fałszywie dodatnich rośnie. Przy wykorzystywaniu testu do wykrywania przypadków u osób bezobjawowych, zwykle stosuje się test o wysokiej czułości w celu wykrycia jak największej liczby przypadków, a następnie potwierdza się wszystkie pozytywne wyniki testem o wysokiej swoistości, aby uniknąć fałszywie dodatnich wyników i związanych z nimi problemów.¹³

Innowacje w interpretacji testów przepływowych

W celu poprawy dokładności interpretacji wyników testów przepływowych opracowano szereg rozwiązań opartych na sztucznej inteligencji i uczeniu maszynowym, które mogą wspomóc prawidłowe odczytanie wyników testu, szczególnie przez niewyszkolonych użytkowników.

Automatyczna interpretacja z wykorzystaniem AI

Opracowano architekturę oprogramowania o nazwie AutoAdapt POC, która integruje automatyczną ekstrakcję membran, samokontrolowane uczenie się i uczenie „few-shot” w celu automatyzacji interpretacji diagnostycznych testów POC (point-of-care) przy użyciu aparatów fotograficznych w smartfonach.¹⁴

System AutoAdapt POC osiągnął dokładność 99-100% na 726 testach (350 pozytywnych, 376 negatywnych). W badaniu przeprowadzonym w punkcie drive-through COVID-19 z udziałem 74 nieprzeszkolonych użytkowników samodzielnie wykonujących testy, 98% uznało zbieranie obrazów za łatwe, a szybko dostosowane modele osiągnęły dokładność klasyfikacji na poziomie 100% zarówno dla testów antygenowych, jak i przeciwciał na COVID-19.¹⁴

System ten zapewnia kontrolę jakości, powiązanie z opieką i śledzenie zdrowia publicznego dla niewyszkolonych użytkowników obsługujących zróżnicowany i dynamiczny zestaw diagnostycznych testów POC.¹⁴

Wspomaganie interpretacji smartfonem

Innym podejściem jest platforma SMARTAI-LFA wspierana sztuczną inteligencją i wykorzystująca smartfony do interpretacji wyników testów. System ten uzyskał 98% dokładności w 135 klinicznych testach opartych na aplikacji smartfonowej z różnymi użytkownikami i smartfonami.¹⁵

Co istotne, w przypadku testów z niskim mianem wirusa, dokładność SMARTAI-LFA utrzymywała się na poziomie powyżej 99%, podczas gdy zaobserwowano znaczny spadek dokładności ludzkiej interpretacji, co wskazuje na niezawodną wydajność systemu SMARTAI-LFA.¹⁵

Analiza porównawcza przy użyciu krzywej ROC wykazała większe wartości pola pod krzywą (AUC) dla SMARTAI-LFA (1,00) w porównaniu z nieprzeszkolonymi osobami (0,79) i ekspertami (0,86), co dowodzi, że SMARTAI-LFA jest doskonałym klasyfikatorem do testów klinicznych.¹⁶ Czułość i swoistość SMARTAI-LFA wyniosły odpowiednio 98,7% i 97,8%, co jest znacznie wyższe niż w przypadku innych podobnych systemów.¹⁶

Prognostyczne znaczenie testów przepływowych

Testy przepływowe, mimo ograniczeń w czułości, są skutecznym narzędziem do identyfikacji przypadków zakażenia SARS-CoV-2 w okresach wysokiej prewalencji, gdy transmisja jest bardziej prawdopodobna ze względu na obecność wysokiego miana wirusa.¹

Wykorzystanie w prognozowaniu przebiegu choroby

Wyniki szybkich testów przepływowych mogą mieć znaczenie prognostyczne, szczególnie gdy rozpatrywane są w kontekście czasu od pojawienia się objawów. Krótsza obecność objawów i wyższe miano wirusa są istotnie związane z pozytywnymi wynikami testów przepływowych, co może wskazywać na wczesną fazę infekcji i potencjalny wysoki poziom zakaźności.¹¹

Narzędzia prognostyczne oferują wyjątkową możliwość wyjaśnienia obserwowanych różnic w wynikach między pacjentami w pandemii COVID-19. Tego typu narzędzia mogą przyczynić się do skutecznego podejścia terapeutycznego poprzez zindywidualizowane leczenie.⁹

Interpretacja wyników w kontekście kwalifikacji do leczenia

W przypadku osób kwalifikujących się do leczenia COVID-19, które uzyskały pozytywny wynik testu, zaleca się niezwłoczny kontakt z lekarzem pierwszego kontaktu, NHS 111 lub specjalistą szpitalnym.¹⁷ Z kolei osoby z wynikiem negatywnym, które są kwalifikowane do leczenia, powinny wykonać łącznie 3 szybkie testy przepływowe w ciągu 3 dni (1 test dziennie), jeśli nadal mają objawy COVID-19.¹⁷

Według wytycznych, pozytywne wyniki testów LFTAg powinny być potwierdzane badaniem laboratoryjnym (przy użyciu testów RT-PCR) w trybie pilnym. W międzyczasie osoby z pozytywnym wynikiem LFTAg powinny poddać się samoizolacji do czasu uzyskania potwierdzającego wyniku testu.¹³

Zalecenia dotyczące stosowania szybkich testów przepływowych

Wyniki badań wskazują, że szybkie testy przepływowe są skuteczne w wykrywaniu zakażeń SARS-CoV-2 o wysokim mianie wirusa, jednak nie są efektywne w identyfikacji przypadków z niskim mianem wirusa.¹⁸

W przypadku uzyskania negatywnego wyniku testu LFT, należy wziąć pod uwagę możliwość wyników fałszywie ujemnych i wykonać dodatkowe testy diagnostyczne.¹⁸

Postępowanie po uzyskaniu wyniku testu

Osoby z pozytywnym wynikiem testu na COVID-19 powinny starać się pozostać w domu i unikać spotkań z ludźmi przez:²³¹⁷

3 dni po dniu wykonania testu, jeśli są w wieku poniżej 18 lat – dzieci i młodzież zwykle są zakaźne przez krótszy czas niż dorośli²³
5 dni po dniu wykonania testu, jeśli są w wieku 18 lat lub starsze²¹⁷

Negatywny wynik szybkiego testu przepływowego COVID-19 oznacza, że mało prawdopodobne jest zakażenie COVID-19. Jednakże zmienną czułość testów antygenowych oznacza, że osoby z wynikiem negatywnym nadal mogą być zakażone.¹⁷⁶

Dostęp do testów przepływowych

Bezpłatne testy przepływowe COVID-19 mogą być dostępne dla osób w wieku 12 lat i starszych, które kwalifikują się do leczenia COVID-19 ze względu na najwyższe ryzyko poważnego zachorowania na COVID-19. Testy te można uzyskać w aptece.²³

Istnieje pilna potrzeba przeprowadzenia dodatkowych, solidnych, dobrze zaprojektowanych i udokumentowanych badań empirycznych z zamierzonych warunków użytkowania, aby dostarczyć informacji dla polityki opartej na dowodach.¹² Potrzeba więcej dowodów, aby zrozumieć dokładność szybkich testów u osób bez objawów oraz zakres, w jakim strategie powtarzania testów mogą prowadzić do zmniejszenia transmisji.⁷

Kolejne rozdziały

Zapraszamy do dalszego czytania naszego leksykonu.

Wybierz kolejny rozdział z menu poniżej, aby otworzyć nową podstronę kompedium wiedzy i uzyskać szczegółowe informację o leku, substancji lub chorobie.

Materiały źródłowe

#1 Test performance of lateral flow rapid antigen tests for COVID-19 in Welsh adult care home staff using routine surveillance data
https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10446167/
Lateral flow tests (LFTs) have been used to screen for SARS-CoV2 in Wales since January 2021. […] We estimated test performance of LFTs conducted in adult care home staff using PCR tests as a reference standard. […] Test result agreement was 99.59% (95%CI 99.5599.63; MCC: 0.38, p0.001). Sensitivity and specificity were 25.65% (95%CI 22.0229.67) and 99.91% (95%CI 99.8999.93), respectively. […] Specificity and negative predictive value were high in an asymptomatic population of care home staff indicating this test is an effective tool for identifying cases of SARS-CoV-2 infection during periods of high prevalence where transmission is likely, due to the presence of high viral loads. […] Positive predictive value results are lower than existing literature yet should be considered in light of the asymptomatic study population and low prevalence (under 1%) at the time most of these tests were conducted.
#2 COVID-19 testing – NHS
https://www.nhs.uk/tests-and-treatments/covid-19-rapid-lateral-flow-test/
A rapid lateral flow test is done to check if you have COVID-19. […] If youre eligible for COVID-19 treatments, youll need to take a COVID-19 rapid lateral flow test if you have any symptoms of COVID-19. […] You may be able to get free COVID-19 rapid lateral flow tests if youre aged 12 or over and you’re eligible for COVID-19 treatment because youre at highest risk of getting seriously ill from COVID-19. […] You can get free COVID-19 rapid lateral flow tests from a pharmacy if youre eligible for COVID-19 treatments because youre at highest risk of getting seriously ill from COVID-19. […] If you test positive for COVID-19, try to stay home and avoid meeting people for: 3 days after the day the test was taken if youre under 18 years children and young people tend to be infectious for less time than adults; 5 days after the day you took your test if youre aged 18 or over. […] If you test negative and youre eligible for COVID-19 treatments, you need to do a total of 3 rapid lateral flow tests over 3 days (1 test a day) if you continue to have COVID-19 symptoms.
#3 COVID-19 testing – NHS
https://www.nhs.uk/conditions/covid-19-rapid-lateral-flow-test/
A COVID-19 rapid lateral flow is a test you do yourself to check for COVID-19. […] A rapid lateral flow test is done to check if you have COVID-19. […] If youâre eligible for COVID-19 treatments, youâll need to take a COVID-19 rapid lateral flow test if you have any symptoms of COVID-19. […] You may be able to get free COVID-19 rapid lateral flow tests if youâre aged 12 or over and youâre eligible for COVID-19 treatment because youâre at highest risk of getting seriously ill from COVID-19. […] You can get free COVID-19 rapid lateral flow tests from a pharmacy if youâre eligible for COVID-19 treatments because youâre at highest risk of getting seriously ill from COVID-19. […] If you test positive for COVID-19, try to stay home and avoid meeting people for 3 days after the day the test was taken if youâre under 18 years â children and young people tend to be infectious for less time than adults.
#4 Frontiers | Recent Progress on Rapid Lateral Flow Assay-Based Early Diagnosis of COVID-19
https://www.frontiersin.org/journals/bioengineering-and-biotechnology/articles/10.3389/fbioe.2022.866368/full
Recent Progress on Rapid Lateral Flow Assay-Based Early Diagnosis of COVID-19 […] The outbreak of the coronavirus disease 2019 (COVID-19) has resulted in enormous losses worldwide. […] Therefore, it is necessary to develop a simple, convenient, and rapid detection strategy for controlling disease recurrence and transmission. Taking advantage of their low-cost and simple operation, point-of-care test (POCT) kits for COVID-19 based on the lateral flow assay (LFA) chemistry have become one of the most convenient and widely used screening tools for pathogens in hospitals and at home. […] The LFA technique for the early diagnosis has great potential for preventing, monitoring, and controlling COVID-19, especially in the post-pandemic era. […] The principles, advantages and disadvantages of these methods will be discussed in detail to provide guidance and suggestions for the prevention and transmission control of the COVID-19 pandemic in the post-pandemic era from the prospective of a diagnostic strategy.
#5 Frontiers | Recent Progress on Rapid Lateral Flow Assay-Based Early Diagnosis of COVID-19
https://www.frontiersin.org/journals/bioengineering-and-biotechnology/articles/10.3389/fbioe.2022.866368/full
The LFA-based diagnostic assays possess significant merits such as low costs, rapid testing, and easy deployment in any setting. […] LFA-based virus tests are suitable for various detection scenarios, including homes, schools, factories and shopping malls. This shows considerable potential for the mass screening of the SARS-CoV-2. […] Although numerous LFA-based COVID-19 detection methods have been developed in a short time, few POCT diagnostic kits has been approved by the FDA. A great challenge lies in the robustness and effectiveness of these methods. […] For viral RNA-based LFAs diagnosis, sample pretreatment involves shipping and storage of specimens, extraction, and purification of RNA, which are critical for the accuracy of diagnosis. […] Generally, antibody-based LFAs are sensitive and accurate. It can also evaluate the stages of SARS-CoV-2 infection according to the level of IgG and/or IgM in the test samples to provide a theoretical reference for early quarantine, treatment, and prognosis recovery. […] Therefore, there is an urgent need to develop an approach to determine antigens with high sensitivity and specificity. The LFA-based method has unique advantages in antigen detection, such as convenient, speed, and suitability for various application scenarios.
#6 How accurate are rapid antigen tests for diagnosing COVID-19? | Cochrane
https://www.cochrane.org/CD013705/INFECTN_how-accurate-are-rapid-antigen-tests-diagnosing-covid-19
Rapid antigen tests are most accurate when they are used in people who have signs or symptoms of COVID-19, especially during the first week of illness. […] In people with confirmed COVID-19, antigen tests correctly identified COVID-19 infection in an average of 73% of people with symptoms, compared to 55% of people without symptoms. […] Tests were most accurate when used in the first week after symptoms began (an average of 82% of confirmed cases had positive antigen tests). […] Rapid antigen tests are less accurate when used in people with no symptoms of COVID-19. […] In people with symptoms, some rapid antigen tests are accurate enough to replace RT-PCR, especially for ruling in the presence of infection. […] The variable sensitivity of antigen tests means that people who test negative may still be infected.
#7 How accurate are rapid antigen tests for diagnosing COVID-19? | Cochrane
https://www.cochrane.org/CD013705/INFECTN_how-accurate-are-rapid-antigen-tests-diagnosing-covid-19
More evidence is needed to understand the accuracy of rapid testing in people without symptoms and the extent to which repeated testing strategies can lead to reduced transmission. […] Antigen tests vary in sensitivity. In people with signs and symptoms of COVID-19, sensitivities are highest in the first week of illness when viral loads are higher. […] The WHO acceptable performance criterion of 97% specificity was met by 17 of 20 assays when tests were used according to manufacturer instructions.
#8 The Performance of Lateral Flow Tests in the Age of the Omicron: A Rapid Systematic Review
https://ouci.dntb.gov.ua/en/works/4O2DR3z7/
Prompt detection and isolation of COVID-19 cases is vital for preventing further viral transmission, and lateral flow or rapid antigen tests have been an important diagnostic tool in this pandemic. […] Overall, it appears that the devices have poorer performance for the omicron variant and when testing samples with cycle threshold (Ct) values greater than 25 and in asymptomatic individuals. […] As most available data were preliminary and had small sample sizes, it is recommended that these data be further studied to better inform and adapt our public health responses. […] Following the outbreak of Omicron and its subvariants, many of the currently available rapid Ag tests (RATs) showed a decrease in clinical performance. […] Both novel RATs demonstrated a high sensitivity of up to 92.86%, (95% CI 82.71%â 98.02%), 94.23%, (95% CI 83.07%â 98.49%), and 97.95% (95% CI 87.76%â 99.89%) compared to the RT-PCR, Omicron RT-PCR, and WGS, respectively.
#9 The Performance of Lateral Flow Tests in the Age of the Omicron: A Rapid Systematic Review
https://ouci.dntb.gov.ua/en/works/4O2DR3z7/
These results demonstrated that SARS-CoV-2 Rapid Antigen Test 2.0 and SARS-CoV-2 Rapid Antigen Test 2.0 Nasal are considered useful and efficient RATs for the detection of SARS-CoV-2, particularly during the current Omicron subvariants wave. […] The diversification of SARS-CoV-2 Omicron variants and evaluation of their detection with molecular and rapid antigen assays. […] Predictive tools provide a unique opportunity to explain the observed differences in outcome between patients of the COVID-19 pandemic. […] Our prognostic tool can contribute to a successful therapeutic approach via personalized treatment.
#10 Lateral Flow Tests Effective at Detecting COVID-19 When Used at Symptom Onset | Today’s Clinical Lab
https://www.clinicallab.com/lateral-flow-tests-effective-at-detecting-covid-19-when-used-at-symptom-onset-25806
A new study by researchers at Queen Mary University of London, University of Oxford, Institute for Advanced Studies, Vienna, and the Medical University of Graz, has found that lateral flow tests detect COVID-19 with similar accuracy to laboratory-based PCR tests, providing they are used at the onset of infection and soon after symptoms start. […] The lateral flow tests detected more than 95 percent of the cases found by PCR, and correctly identified 89 percent of cases as negative. […] Previous studies have suggested lateral flow tests may be less sensitive than PCR in detecting COVID-19, particularly among asymptomatic individuals and during the early or late stage of an infection when the viral load is lowest. But we have found that in patients who are newly symptomatic, the two testing methods have similar levels of accuracy.
#11 Lateral Flow Tests Effective at Detecting COVID-19 When Used at Symptom Onset | Today’s Clinical Lab
https://www.clinicallab.com/lateral-flow-tests-effective-at-detecting-covid-19-when-used-at-symptom-onset-25806
In our study, both shorter duration of symptoms and higher viral load were significantly associated with positive lateral flow tests. This highlights the necessity of testing at early infection with lateral flow tests, and shows that in patients who are newly symptomatic, the two testing methods have similar levels of accuracy. […] This study provides evidence that lateral flow tests can accurately detect SARS-CoV-2 infection as an alternative to PCR testing among symptomatic patients in a real-life primary care setting across a large geographical area.
#12 SARS-CoV-2 antigen lateral flow tests for detecting infectious people: linked data analysis | The BMJ
https://www.bmj.com/content/376/bmj-2021-066871
Objectives To investigate the proportion of lateral flow tests (LFTs) that produce negative results in those with a high risk of infectiousness from SARS-CoV-2, to investigate the impact of the stage and severity of disease, and to compare predictions made by influential mathematical models with findings of empirical studies. […] The analysis predicted that of those with a viral culture positive result, Innova would miss 20% attending an NHS Test-and-Trace centre, 29% without symptoms attending municipal mass testing, and 81% attending university screen testing without symptoms, along with 38%, 47%, and 90% of sources of secondary cases. […] The proportion of infectious people with SARS-CoV-2 missed by LFTs is substantial enough to be of clinical importance. […] Key models have substantially overestimated the sensitivity of LFTs compared with empirical data. […] An urgent need exists for additional robust well designed and reported empirical studies from intended use settings to inform evidence based policy.
#13 Accuracy of Lateral Flow Antigen Tests for COVID-19
https://www.rcpath.org/discover-pathology/news/accuracy-of-lateral-flow-antigen-tests-for-covid-19.html
The Royal College of Pathologists (RCPath) recognises the potential role of Lateral Flow Antigen Tests for COVID-19 (LFTAg) when used in a controlled and targeted way as part of an overall testing strategy. However, the public is reminded that the currently-used versions of these tests are not of sufficient sensitivity or accuracy to rule out the possibility that a negative result may not be correct. […] Positive results by LFTAg should be confirmed by testing in a laboratory (using reverse transcription-polymerase chain reaction testing (RT-PCR)) as a matter of urgency. In the meantime, individuals with a positive LFTAg result should self-isolate pending the confirmatory test result. […] As the prevalence of infection declines in the population, the test’s positive predictive value will also decline, meaning, the proportion of positive results which are false positives will rise. When utilising a test for case finding in asymptomatic people, it is usual to employ a test with high sensitivity in order to detect as many cases as possible, and then to confirm any positive results with a test of high specificity, to avoid false positives and the downstream problems associated with these.
#14 Rapidly adaptable automated interpretation of point-of-care COVID-19 diagnostics | Communications MedicineClose bannerClose banner
https://www.nature.com/articles/s43856-023-00312-x
Rapidly adaptable automated interpretation of point-of-care COVID-19 diagnostics […] Point-of-care diagnostic devices, such as lateral-flow assays, are becoming widely used by the public. […] We developed a software architecture called AutoAdapt POC that integrates automated membrane extraction, self-supervised learning, and few-shot learning to automate the interpretation of POC diagnostic tests using smartphone cameras in a scalable manner. […] Here we show AutoAdapt POC to yield 99% to 100% accuracy over 726 tests (350 positive, 376 negative). […] In a COVID-19 drive-through study with 74 untrained users self-testing, 98% found image collection easy, and the rapidly adapted models achieved classification accuracies of 100% on both COVID-19 antigen and antibody test kits. […] The study demonstrates how rapid domain adaptation in machine learning can provide quality assurance, linkage to care, and public health tracking for untrained users across diverse POC diagnostic tests. […] It can be difficult to correctly interpret the results of rapid diagnostic tests that give a visual readout, such as COVID rapid tests. […] The algorithm was accurate at interpreting results obtained by members of the public using various COVID rapid tests and diagnostic tests with similar outputs used for other infections. […] The use of this algorithm should enable accurate interpretation of rapid diagnostic tests by members of the public and hence enable improved medical care. […] The approach was further validated with untrained users in a drive-through tent for COVID-19 testing, with the algorithm correctly identifying 100% of antigen and antibody tests. […] AutoAdapt POC provides quality assurance, linkage to care, and public health tracking to untrained users operating a diverse and dynamic set of POC diagnostic tests. […] The performance using only the base model (i.e., the pre-trained feature extractor) was assessed on the new kits, compared to the rapid adaptation method using 10 shots (20 zone images). […] The results illustrated the importance of both self-supervised pre-training component and supervised contrastive (SupCT) loss component, with the combination of both components producing high accuracy requiring the smallest number of training images of a new test kit. […] We evaluated the AutoAdapt POC algorithm on images of rapid antigen and antibody tests taken by 74 untrained users during a COVID-19 drive-through study. […] The rapidly adapted model identified with 100% accuracy the results for all 42 Flowflex antigen tests and all 30 ACON antibody tests in the evaluation set. […] Over the 105 test kits, the AutoAdapt POC algorithm correctly interpreted all 105 kits (100% accuracy), which matched visual interpretation by an expert.
#15 Sample-to-answer platform for the clinical evaluation of COVID-19 using a deep learning-assisted smartphone-based assay | Nature Communications
https://www.nature.com/articles/s41467-023-38104-5
Since many lateral flow assays (LFA) are tested daily, the improvement in accuracy can greatly impact individual patient care and public health. […] However, current self-testing for COVID-19 detection suffers from low accuracy, mainly due to the LFA sensitivity and reading ambiguities. […] We acquired 98% accuracy across 135 smartphone application-based clinical tests with different users/smartphones. […] Furthermore, with more low-titer tests, we observed that the accuracy of SMARTAI-LFA was maintained at over 99% while there was a significant decrease in human accuracy, indicating the reliable performance of SMARTAI-LFA. […] We envision a smartphone-based SMARTAI-LFA that allows continuously enhanced performance by adding clinical tests and satisfies the new criterion for digitalized real-time diagnostics.
#16 Sample-to-answer platform for the clinical evaluation of COVID-19 using a deep learning-assisted smartphone-based assay | Nature Communications
https://www.nature.com/articles/s41467-023-38104-5
The ROC curve shows a general overview of the three different models; a larger value of the area under the curve (AUC) indicates a better classifier. […] From the ROC curve in Fig. 3b, we observe larger AUCs for SMARTAI-LFA (1.00) compared with that for untrained individuals (0.79) and human experts (0.86); this demonstrates that SMARTAI-LFA is an excellent classifier for clinical assays. […] To closely study the reason for the accuracy reaching 100%, we explored the effect of the training and test datasets discussed later. […] The accuracy of the blind test using 1,500 test images from untrained individuals (n=10), human experts (n=10), and SMARTAI-LFA (Fig. 1b). […] The sensitivity and specificity of SMARTAI-LFA from the confusion matrix are 98.7% and 97.8%, respectively, which are notably higher than those of xRcovid with our training set (91.7% and 84.0%) and xRcovid (94.2% and 19.0%). […] The accuracy data in Fig. 4h explicitly confirms the more reliable performance of SMARTAI-LFA in comparison to humans (untrained individuals and human experts).
#17 COVID-19 testing – NHS
https://www.nhs.uk/conditions/covid-19-rapid-lateral-flow-test/
If you test positive for COVID-19, try to stay home and avoid meeting people for 5 days after the day you took your test if youâre aged 18 or over. […] If you test positive and youâre eligible for COVID-19 treatments, call your GP surgery, NHS 111 or hospital specialist as soon as possible. […] If you get a negative COVID-19 rapid lateral flow test result, it means it’s unlikely you have COVID-19. […] If you test negative and youâre eligible for COVID-19 treatments, you need to do a total of 3 rapid lateral flow tests over 3 days (1 test a day) if you continue to have COVID-19 symptoms.
#18 Test performance of lateral flow rapid antigen tests for COVID-19 in Welsh adult care home staff using routine surveillance data
https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10446167/
These results suggest that whilst lateral flow tests are effective for identifying SARS-COV-2 infections with high viral loads, they are not effective at identifying cases with a low viral load. […] When an LFT provides a negative result, false negatives should be considered and additional diagnostic tests performed.